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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001332`

染色体: Chr02 坐标: 24773071-24777840 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001332`
名称	SmilChr02G001332
描述	uncharacterized SmilChr02G001332
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	24773071 - 24777840 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008179`
GeneID	`131008179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008179`
原始查询	`LOC131008179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=40.7; qcov=0.047; evalue=3.75e-08; confidence=weak
Rice	`Os08g0202300` - identity=30.9; qcov=0.343; evalue=2.24e-56; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF00665 (rve); PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791054.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791054.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791054.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791054.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791054.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:24774839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr2:24774891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr2:24774921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B45,B76
`Chr2:24776977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:24777613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr2:24777666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791054.1

1263 aa

632

1263

RVT_1

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

rve

PF00078 RVT_1 521-674 aa PF17919 RT_RNaseH_2 702-798 aa PF17917 RT_RNaseH 726-829 aa PF00665 rve 913-1006 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791054.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	521	674	3.4e-31	109.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057791054.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	702	798	4.6e-32	110.8	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057791054.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	726	829	1.2e-36	125.7	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057791054.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	913	1006	1.7e-15	57.8	Integrase core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935071.1
ATGACAAGAACGGATGAGAAGTTAGAGGCTCAAGCCAAGCAATTGAAAATGCTTGAGATACAAGTGGGACAAATTGCCGAGTCTATAAACAATCAACACCAACAAGGGCAATTCCCAAGCAACACAATCGTGAATCCCAAGGAGCATTGCAAGGCCATTGCTCTAAGGAGTGGGACAACATATGAAGAACCCAAGATGCCCGACGAAGAAGATAGAAGTGGTGTTGTGGTTGAAGTTGGAGATGGCAACCCTTCAAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008179
ATGACAAGAACGGATGAGAAGTTAGAGGCTCAAGCCAAGCAATTGAAAATGCTTGAGATACAAGTGGGACAAATTGCCGAGTCTATAAACAATCAACACCAACAAGGGCAATTCCCAAGCAACACAATCGTGAATCCCAAGGAGCATTGCAAGGCCATTGCTCTAAGGAGTGGGACAACATATGAAGAACCCAAGATGCCCGACGAAGAAGATAGAAGTGGTGTTGTGGTTGAAGTTGGAGATGGCAACCCTTCAAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791054.1
MTRTDEKLEAQAKQLKMLEIQVGQIAESINNQHQQGQFPSNTIVNPKEHCKAIALRSGTTYEEPKMPDEEDRSGVVVEVGDGNPSKEQGDRGKKKEVHINIPLIEALKQMPSYAKFLKEVISNKRKMGENETVNLTEECSAVLQRKIPTKIKDPGSFTIPCDIGNDRFGKALCDLGASINLMPLSIFNKLEIGTIKPTTIALQMADRSVSYPKGIVEDVLVKVNNFIFPVDFVVLDMVEDKDVPLILGRPILATGRALID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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