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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001364`

染色体: Chr02 坐标: 25615077-25621126 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001364`
名称	SmilChr02G001364
描述	uncharacterized SmilChr02G001364
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	25615077 - 25621126 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008190`
GeneID	`131008190`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008190`
原始查询	`LOC131008190`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=24.2; qcov=0.564; evalue=2.16e-09; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008190

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791065.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791065.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791065.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791065.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791065.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:25615100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B125,B87,B96,C71
`Chr2:25615100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B87,B96,C71
`Chr2:25615165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:25615192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:25615200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:25615207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:25615215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:25615228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:25616812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B60
`Chr2:25616834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:25616836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B60
`Chr2:25616838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791065.1

344 aa

172

344

DUF8566

DUF1985

PF29561 DUF8566 56-233 aa PF09331 DUF1985 78-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791065.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	56	233	6.1e-10	39.9	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057791065.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	78	212	2.9e-15	57.2	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935082.1
CCGTCTCCATCTCGCCTCTCAACAAACTCAGACTCTGAACGAACTCAGCCAGATCTCGCCGGCTCCATTTTTCCGGTGGACGGAATCAACAAACTCAGCCTCTCAACAAACTCAGGCTCTGAACGAACTCAGCCTCAGCTCTCTACCGGCAAGCTATCAACTTTCAACCACCTGAAATCTCATCAGCTTGTCTCTCGCCTTTCTCCATTTCCGTCATGGATGCACCGCAAGAGGAGAATTCTAATTATTTGAGGCCGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008190
ATGGATGCACCGCAAGAGGAGAATTCTAATTATTTGAGGCCGAGTACAATTAATGTGGCTTCAAATGTTGGGACATATTACAAGACAAAATACTTGAAAATGGTTAGGAAGGTATTGAATGCGAAAGGTGGTCAACCGTTGGTGGACAGATTTTTAAGTGGTTGTTTCGGACACTTATTAGATTGGAATCCGGGGTCAAAGTGTGCTATGGCTGTTCACCATGTAGTTTCTCGCCAAATCCGATCAAATGATAATGGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791065.1
MDAPQEENSNYLRPSTINVASNVGTYYKTKYLKMVRKVLNAKGGQPLVDRFLSGCFGHLLDWNPGSKCAMAVHHVVSRQIRSNDNGLWFFINGSRLNFSERDYALVTWLNFGETDFDTRAHHDLRNVEVFRKFCCGQRTVKVETLVDLFENYDIDDQDGSLLLRVAHVLVLYGMLLGYEPDKNVADWVWALVNDLDAFAQFPWAAYSYQLLCQYVNNFSTHDKYKLYGPVWALHVWSLEIIPELRTAVGTHLDGGAHPRC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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