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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001366`

染色体: Chr02 坐标: 25740127-25740813 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001366`
名称	SmilChr02G001366
描述	uncharacterized SmilChr02G001366
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	25740127 - 25740813 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008192`
GeneID	`131008192`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008192`
原始查询	`LOC131008192`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0656500` - identity=24.5; qcov=0.697; evalue=1.33e-07; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00665 (rve)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008192

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791067.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791067.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791067.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791067.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791067.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:25740129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:25740147`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A7,B125,B19,B71,C16,C19,C33,C47,C67
`Chr2:25740150`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A7,B125,B19,B71,C16,C19,C33,C47,C67
`Chr2:25740174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:25740178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B118,B41,C51,C86
`Chr2:25740190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:25740231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B89,C44,C59,C6
`Chr2:25740268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B61,B69,D10
`Chr2:25740273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B61,D10
`Chr2:25740279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B61
`Chr2:25740289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B61,D10
`Chr2:25740290`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B61,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791067.1

228 aa

114

228

rve

PF00665 rve 8-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791067.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	8	105	1.6e-17	64.3	Integrase core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935084.1
ATGGAGGTCATGTACGCTGCATGCCCATTTGACAAGTGGGGCATAGACATCGTCGGGAAACTACCCACAGTACCAGGTGGCAAGTGCTTTCTCATTGTGGCGGTGGATTATTTCTCCAAATGGGTCGAGGCCGAAGCAGTTGCAAAGATCGACGAAGTGACAGTGGAACGGTTTATATGGCGAAACATTTGTTGTAGATTTGGAGTCCCGAGGATCATTGTATCAAACAACGGAACCCAATTCACAAGGCAGAGGATTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008192
ATGGAGGTCATGTACGCTGCATGCCCATTTGACAAGTGGGGCATAGACATCGTCGGGAAACTACCCACAGTACCAGGTGGCAAGTGCTTTCTCATTGTGGCGGTGGATTATTTCTCCAAATGGGTCGAGGCCGAAGCAGTTGCAAAGATCGACGAAGTGACAGTGGAACGGTTTATATGGCGAAACATTTGTTGTAGATTTGGAGTCCCGAGGATCATTGTATCAAACAACGGAACCCAATTCACAAGGCAGAGGATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791067.1
MEVMYAACPFDKWGIDIVGKLPTVPGGKCFLIVAVDYFSKWVEAEAVAKIDEVTVERFIWRNICCRFGVPRIIVSNNGTQFTRQRIADFCDRMDITQRFVSVAHPQENVQVEMANRSICEGIKKRLNQSKGKWVEELDTVLWAYRTSLKTATGEAPFTLVYRSNAVIPVGPDWNHIALQLTTRNKIQNSEEQSSSWWKYRGMKPKSEQQSIKHHQGGIRQEGQSKEAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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