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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001447`

染色体: Chr02 坐标: 27137826-27139943 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001447`
名称	SmilChr02G001447
描述	uncharacterized SmilChr02G001447
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	27137826 - 27139943 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008213`
GeneID	`131008213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008213`
原始查询	`LOC131008213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=31.4; qcov=0.43; evalue=3.87e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791089.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791089.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791089.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791089.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:27137846`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	134	A1,A13,A14,A15,A16,A18,A2,A21,A22,A24,A25,A4,A5,A7,A8,B1,B100,B101,B102,B108,B109,B111,B112,B113,B115,B117,B121,B122,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B136,B139,B140,B15,B17,B24,B25,B27,B28,B29,B30,B37,B38,B39,B4,B40,B44,B45,B48,B5,B50,B55,B56,B58,B59,B6,B62,B65,B68,B7,B70,B71,B75,B76,B80,B84,B85,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B97,C1,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C28,C31,C32,C37,C4,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C50,C52,C54,C55,C59,C61,C62,C63,C67,C68,C69,C70,C73,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C86,C9,D11,D2,D5,D8,D9
`Chr2:27137848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B25,B68,C48
`Chr2:27137853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:27137901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr2:27137916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,B6,B93,C85
`Chr2:27137979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C47,C8
`Chr2:27137995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr2:27138024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B121
`Chr2:27138057`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B17
`Chr2:27138057`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B17
`Chr2:27138059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,C35,C37,C51
`Chr2:27138074`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A18,A7,B109,B135,B2,B32,B4,B57,B67,B68,B86,B99,C13,C30,C36,C40,C46,C60,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791089.1

630 aa

315

630

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 134-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791089.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	134	199	2e-10	41.6	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935106.1
ATGAAGAAGAGGGTGGACGAGTCTGATAGTCAGTCCATCACCCCCGTGTTTGAGGAGGAGAGGCCAAGGGAGAAAGAGCGACTGAAGGACCAGAGGTCAGGGAAATCGAACAGGGCAGAGAAGTCATATAGGGCAGATAGGTCCCATCGTTCAGAGAAATCACGCTATGTAGAGAGGTCAGAGGAACGGGAGCTAGAATATTCTACTGGCAAGCCAGGGCACAGGGTTCACAAACGGCACGCCCATGACGCACCAAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008213
ATGAAGAAGAGGGTGGACGAGTCTGATAGTCAGTCCATCACCCCCGTGTTTGAGGAGGAGAGGCCAAGGGAGAAAGAGCGACTGAAGGACCAGAGGTCAGGGAAATCGAACAGGGCAGAGAAGTCATATAGGGCAGATAGGTCCCATCGTTCAGAGAAATCACGCTATGTAGAGAGGTCAGAGGAACGGGAGCTAGAATATTCTACTGGCAAGCCAGGGCACAGGGTTCACAAACGGCACGCCCATGACGCACCAAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791089.1
MKKRVDESDSQSITPVFEEERPREKERLKDQRSGKSNRAEKSYRADRSHRSEKSRYVERSEERELEYSTGKPGHRVHKRHAHDAPKERREHGRHKEDKRAKTSRFHPINNRSPFSDDILADTLPRSYKPISLDYDGTTDPEVHLNRFEGLVTLHMYIEGIKCRIFSTTLTGPAQLWFGTLAPNSIYSFEDLQTRFLRQFASSRRVGKSALSLMDIKQDQNETLREYTARFNLAALEIRPAKDFDDIMARLPGYLQLEDAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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