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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001505`

染色体: Chr02 坐标: 28087028-28087984 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001505`
名称	SmilChr02G001505
描述	uncharacterized SmilChr02G001505
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28087028 - 28087984 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008227`
GeneID	`131008227`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008227`
原始查询	`LOC131008227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G29765` (AT3G29765) ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666] identity=50.6; qcov=0.969; evalue=5.16e-104; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=41.4; qcov=0.365; evalue=6.4e-20; confidence=low
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008227

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791103.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791103.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791103.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791103.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791103.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28087141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr2:28087264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B102,C46
`Chr2:28087313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,C16,C46
`Chr2:28087331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,C16,C46
`Chr2:28087352`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B119,B136,B16,B45,C13,C65
`Chr2:28087660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B102,C27,C50,C53
`Chr2:28087743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791103.1

318 aa

159

318

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 235-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791103.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	235	294	4.2e-07	30.4	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935120.1
ATGTGCATTTTTGTAGTAGTGATTATTGATGTTCTTGAGTATGTTGGGAAGAATGGAAATGATGATGCACAGAGGGCTGAAGCCATTGATTTGTTAGAAGTTATGAATCGCTTTGAGTTTGTGTTTGTGTTACATATTATGAGGAAAATCTTGGGAATCACACATGAACTATCTCAAGTGCTACAAAGAAAGGATCAAGATATTGTTAATGCTATGAATCTTGTTAAAGTGGCAAAAACACGTTTGCAAGCGATGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008227
ATGTGCATTTTTGTAGTAGTGATTATTGATGTTCTTGAGTATGTTGGGAAGAATGGAAATGATGATGCACAGAGGGCTGAAGCCATTGATTTGTTAGAAGTTATGAATCGCTTTGAGTTTGTGTTTGTGTTACATATTATGAGGAAAATCTTGGGAATCACACATGAACTATCTCAAGTGCTACAAAGAAAGGATCAAGATATTGTTAATGCTATGAATCTTGTTAAAGTGGCAAAAACACGTTTGCAAGCGATGAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791103.1
MCIFVVVIIDVLEYVGKNGNDDAQRAEAIDLLEVMNRFEFVFVLHIMRKILGITHELSQVLQRKDQDIVNAMNLVKVAKTRLQAMRDDGWEILLTEVSKFCSTHEIIMLDMEDEYVARGRGRRRVEKMTNLHHYRVELFYYVIDMQVLELNHRFDEINTELLLCMACLDPRDSFSAFDVKKLVRLAKLYPSEFSEVTLYELESQLENFIFDVRLDEKFSKLLGIGGLAQKMVSTRKHEIFPLVYLLIKLSLVLPVATATV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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