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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002422`

染色体: Chr01 坐标: 41698472-41698990 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002422`
名称	SmilChr01G002422
描述	uncharacterized SmilChr01G002422
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	41698472 - 41698990 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008228`
GeneID	`131008228`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008228`
原始查询	`LOC131008228`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=24.8; qcov=0.936; evalue=7.15e-07; confidence=weak
Rice	`Os02g0630250` - identity=27.4; qcov=0.89; evalue=4.84e-09; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008228

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791107.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057791107.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791107.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791107.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791107.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:41698501`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A18,A25,B117,B137,B17,B19,B21,B24,B3,B36,B44,B47,B53,B58,B70,B77,B82,B85,B89,C10,C18,C25,C26,C28,C34,C39,C45,C65,C8,D8,D9
`Chr1:41698584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,C49,C50,C72,C75
`Chr1:41698586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B13,B132
`Chr1:41698623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:41698624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B69,C13,C77,D7
`Chr1:41698639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:41698655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:41698660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B132,B59
`Chr1:41698669`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A2
`Chr1:41698669`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A2
`Chr1:41698723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:41698773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791107.1

172 aa

172

RVT_3

PF13456 RVT_3 24-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791107.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	24	145	5.4e-13	49.7	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935124.1
ATGGCGTCACCGATCATCAACTCGTGTGTTGGTTGGCATGCTATCCAGGTGGGGTGGGTGAGATGCGGTGTGGATGCTGCATTTTTTGAGCATGATAAGTCTATGGGCATTGGAATGGTGGTACGAGACCATGCAGGTGAGTTTGTGATAGAAAAGTTGATGAAGGTGCGGGGGAGTAGGGACGTTGCGGAAGGTGAACTCATGGGCATAAATGAGGCGTTGTCTTGGCTTAAGTCCCTTGGGTATGAGCATGGTTGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008228
ATGGCGTCACCGATCATCAACTCGTGTGTTGGTTGGCATGCTATCCAGGTGGGGTGGGTGAGATGCGGTGTGGATGCTGCATTTTTTGAGCATGATAAGTCTATGGGCATTGGAATGGTGGTACGAGACCATGCAGGTGAGTTTGTGATAGAAAAGTTGATGAAGGTGCGGGGGAGTAGGGACGTTGCGGAAGGTGAACTCATGGGCATAAATGAGGCGTTGTCTTGGCTTAAGTCCCTTGGGTATGAGCATGGTTGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791107.1
MASPIINSCVGWHAIQVGWVRCGVDAAFFEHDKSMGIGMVVRDHAGEFVIEKLMKVRGSRDVAEGELMGINEALSWLKSLGYEHGWIDCDSKIACDAVLKGVGFINERGVLADYCRRELSTMPGVQVCNVRRSRNAIAHCLAKAARDISTLHVWNEPSSFVEGHLHVPCSCG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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