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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001526`

染色体: Chr02 坐标: 28398856-28400880 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001526`
名称	SmilChr02G001526
描述	uncharacterized SmilChr02G001526
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28398856 - 28400880 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008235`
GeneID	`131008235`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008235`
原始查询	`LOC131008235`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=34.6; qcov=0.397; evalue=2.16e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008235

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791110.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791110.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791110.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791110.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28398858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:28398906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C68
`Chr2:28398911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B46,B55,C16
`Chr2:28398912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B44,C25,C42
`Chr2:28398924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B18,B73,C25,D3
`Chr2:28398937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C75
`Chr2:28399012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:28399033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B3
`Chr2:28399044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B120,B54,C80
`Chr2:28399051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:28399122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr2:28399133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791110.1

647 aa

324

647

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 46-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791110.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	46	111	2e-10	41.6	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935127.1
ATGGAGCATGGTAGACATAAGGAGGATAAAAGGGCCAAAATGTCGAGGTTCCATCCCATCAACAACCGCAGTCCTTTCTCCGACGATATTCTGGCAGATACTCTACCCAGAAGCTACAAGCCTATTTCTCTGGATTACGATGGCACCACTGATCCAGAAGTCCACCTCAATCGGTTCGAGGGGTTGGTCACACTGCATATGTATACTGAGGGCATCAAGTGCCGCATCTTCTCCACTACTCTCACTGGACCAGCTCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008235
ATGGAGCATGGTAGACATAAGGAGGATAAAAGGGCCAAAATGTCGAGGTTCCATCCCATCAACAACCGCAGTCCTTTCTCCGACGATATTCTGGCAGATACTCTACCCAGAAGCTACAAGCCTATTTCTCTGGATTACGATGGCACCACTGATCCAGAAGTCCACCTCAATCGGTTCGAGGGGTTGGTCACACTGCATATGTATACTGAGGGCATCAAGTGCCGCATCTTCTCCACTACTCTCACTGGACCAGCTCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791110.1
MEHGRHKEDKRAKMSRFHPINNRSPFSDDILADTLPRSYKPISLDYDGTTDPEVHLNRFEGLVTLHMYTEGIKCRIFSTTLTGPAQLWFGTLAPNSIYSFEDLQTRFLCQFASSRRVGKSALSLMDIKQDQNEILREYSARFNLAAQEIRPAKDFDDIMARLLGYLQLEDARMARKAENDKHKAKRAEEAPERQRHQDRAPFRGLPPRVLPPQGGMPPHQQRTVNEVTRFAEYTPLNKPQEEIFHLIKNQPFFRAPGTYR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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