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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001536`

染色体: Chr02 坐标: 28603501-28604426 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001536`
名称	SmilChr02G001536
描述	uncharacterized SmilChr02G001536
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28603501 - 28604426 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008238`
GeneID	`131008238`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008238`
原始查询	`LOC131008238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=40.4; qcov=0.777; evalue=1.37e-34; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=49.6; qcov=0.532; evalue=4.03e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008238

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791113.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057791113.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057791113.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791113.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791113.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28603503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:28603513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:28603533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:28603542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B140
`Chr2:28603546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr2:28603547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B140,C17
`Chr2:28603580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B2
`Chr2:28603589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:28603614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,D2
`Chr2:28603617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C11,C73
`Chr2:28603634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B140,B49
`Chr2:28603649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791113.1

220 aa

110

220

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 40-93 aa PF04827 Plant_tran 91-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791113.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	40	93	2.5e-43	148.8	Plant transposon protein
`XP_057791113.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	91	155	2.5e-43	148.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935130.1
ATGCTAGAAAATGGTGGAGCAGCTGACCAGTACGACGAGTACCTACGGATTGCGAAGTCTACTTCGTTGGATTGCATGCGCCGCTTCTGTGCGGTGGTCATCCAACGCTTCGGCACGGAGTACTTGAGAAGACCAACCCCTGCCGACTGCCAAAGGCTTATGGCAATGCACGAGGCGAAACACGGCTTCCCAGGAATGCTTGGAAGTCTTGATTGCATGCACTGGGCGTGGAAGAATTGTCCAGTGGCATGGCACGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008238
ATGCTAGAAAATGGTGGAGCAGCTGACCAGTACGACGAGTACCTACGGATTGCGAAGTCTACTTCGTTGGATTGCATGCGCCGCTTCTGTGCGGTGGTCATCCAACGCTTCGGCACGGAGTACTTGAGAAGACCAACCCCTGCCGACTGCCAAAGGCTTATGGCAATGCACGAGGCGAAACACGGCTTCCCAGGAATGCTTGGAAGTCTTGATTGCATGCACTGGGCGTGGAAGAATTGTCCAGTGGCATGGCACGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791113.1
MLENGGAADQYDEYLRIAKSTSLDCMRRFCAVVIQRFGTEYLRRPTPADCQRLMAMHEAKHGFPGMLGSLDCMHWAWKNCPVAWHGAYTRDEKSKRFKMMQEVARKDIELAFGVLQARWAIIKGPACLWSKAELSDIMFTCIILHNMIVQDEGDHATEWANEGNDEASSSSTATRPRRGAPPEFRQYVARQVSMRDTKMHAHLTLDLKEHIWSQFGPIDH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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