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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001545`

染色体: Chr02 坐标: 28699559-28700865 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001545`
名称	SmilChr02G001545
描述	uncharacterized SmilChr02G001545
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28699559 - 28700865 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008240`
GeneID	`131008240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008240`
原始查询	`LOC131008240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.4; qcov=0.686; evalue=8.44e-19; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=31.9; qcov=0.678; evalue=4.04e-38; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791115.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791115.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791115.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791115.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28699570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B59,B92,B95
`Chr2:28699572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B64
`Chr2:28699586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:28699693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C30
`Chr2:28699705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:28699713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B64
`Chr2:28699739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B37
`Chr2:28699762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D3
`Chr2:28699762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:28699772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr2:28699907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:28699910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791115.1

370 aa

185

370

SWIM

PF04434 SWIM 135-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791115.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	135	164	8.5e-07	29.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935132.1
CTCAAGAAGAGGTTCTAGATTGTTGCATGGAGCTCATTCCAAGAAGAGTACATCTGAACTTAGCCAAGATAAGCAGAATAAACAAGAAGGTAGCTCAAGACCTTCTTCAATATCCTCCTGAAAACTGGTGCAGAGCCTTCCAAACTCCAAGGTGCTCAACTTTCATGGTAGACAACAATATCTCAGAGTCTTTTAATTCGAGTATATTTGATGCTAGACACAAACCAATCATTTCATTGCTTGAGGACATTAGGATGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008240
ATGGAGCTCATTCCAAGAAGAGTACATCTGAACTTAGCCAAGATAAGCAGAATAAACAAGAAGGTAGCTCAAGACCTTCTTCAATATCCTCCTGAAAACTGGTGCAGAGCCTTCCAAACTCCAAGGTGCTCAACTTTCATGGTAGACAACAATATCTCAGAGTCTTTTAATTCGAGTATATTTGATGCTAGACACAAACCAATCATTTCATTGCTTGAGGACATTAGGATGATAGTTATGTCTAGGATTCGGGATGGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791115.1
MELIPRRVHLNLAKISRINKKVAQDLLQYPPENWCRAFQTPRCSTFMVDNNISESFNSSIFDARHKPIISLLEDIRMIVMSRIRDGRYVVSSWKVYWCPNAMELFEANKQESVQCNVLWNGDNGYEVSDGEDKHIVFIDTMRCTCRARELTGIPCSHAIAAFYSSSMEPLSVMSKWYHRETYRKCYEHAIQPIPDVKFWTVKENDAIEPPPVEKKVGRPKKNRVRASNEPRLNHKLSRKGKVQHCSLCGSTAHKKDKCPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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