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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001556`

染色体: Chr02 坐标: 28862970-28863392 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001556`
名称	SmilChr02G001556
描述	uncharacterized SmilChr02G001556
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28862970 - 28863392 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008243`
GeneID	`131008243`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008243`
原始查询	`LOC131008243`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0681F05.114; symbol=P0681F05.114; hit=Os07g0530300; species=rice; confidence=medium
产物	P0681F05.114; symbol=P0681F05.114; hit=Os07g0530300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G20830` (AT2G20830) folic acid binding / transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816615] identity=47.4; qcov=0.829; evalue=2.31e-35; confidence=medium
Rice	`Os07g0530300` (P0681F05.114) - identity=52.3; qcov=0.914; evalue=6.83e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09811 (Yae1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008243

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791117.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791117.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057791117.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057791117.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057791117.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28862993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B122,B86,C36,C75
`Chr2:28863012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C14
`Chr2:28863028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,D4
`Chr2:28863038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:28863057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B69
`Chr2:28863107`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B2,B38,B82,C81,C83
`Chr2:28863107`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B2,B38,B82,C81,C83
`Chr2:28863109`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A21,B121,B128,B140,B26,C11,C24,C29,C69,D5
`Chr2:28863131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr2:28863137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:28863145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C3
`Chr2:28863146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791117.1

140 aa

140

Yae1_N

PF09811 Yae1_N 22-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791117.1`	Pfam	`PF09811`	Yae1_N	Family	22	60	2.8e-07	30.8	Essential protein Yae1, N terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935134.1
ATGGACGCCATTGAAGACATCTTCGATTCTTCGCTAAATCTTGAGGATTCCCACTTGAGAGAAGGCTACGACGAGGGCTACGCTGACGGCATAATCTCAGGCAAGGGAGAGGGCCAACAAGTCGGGCTGAAAACCGGGTTCGAAACGGGCGAGGAATTGGGCTTTTACCGCGGCTGCGTCGCCGTCTGGAGCTCCGCCATCCGGGCCGACCCGAATTTCATGTCTGCCCGAATTCAGAAGACAATCAAGCAGATGGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008243
ATGGACGCCATTGAAGACATCTTCGATTCTTCGCTAAATCTTGAGGATTCCCACTTGAGAGAAGGCTACGACGAGGGCTACGCTGACGGCATAATCTCAGGCAAGGGAGAGGGCCAACAAGTCGGGCTGAAAACCGGGTTCGAAACGGGCGAGGAATTGGGCTTTTACCGCGGCTGCGTCGCCGTCTGGAGCTCCGCCATCCGGGCCGACCCGAATTTCATGTCTGCCCGAATTCAGAAGACAATCAAGCAGATGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791117.1
MDAIEDIFDSSLNLEDSHLREGYDEGYADGIISGKGEGQQVGLKTGFETGEELGFYRGCVAVWSSAIRADPNFMSARIQKTIKQMDELLRNYPMLEPENESVSDAMDALRLKFRVICASLNLKLEYKGYPKASDAGDIGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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