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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001558`

染色体: Chr02 坐标: 28865728-28867091 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001558`
名称	SmilChr02G001558
描述	uncharacterized SmilChr02G001558
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28865728 - 28867091 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008244`
GeneID	`131008244`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008244`
原始查询	`LOC131008244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0681F05.114; symbol=P0681F05.114; hit=Os07g0530300; species=rice; confidence=low
产物	P0681F05.114; symbol=P0681F05.114; hit=Os07g0530300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G20830` (AT2G20830) folic acid binding / transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816615] identity=46.6; qcov=0.411; evalue=5.84e-33; confidence=low
Rice	`Os07g0530300` (P0681F05.114) - identity=52.3; qcov=0.446; evalue=9.39e-46; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09811 (Yae1_N); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008244

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791118.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057791118.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791118.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791118.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791118.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28865851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:28866079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,B69
`Chr2:28866084`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B45
`Chr2:28866084`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B45
`Chr2:28866101`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B45
`Chr2:28866101`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B45
`Chr2:28866104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:28866133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A23,C29,C33,C49,C6
`Chr2:28866133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,C29,C33,C49,C6
`Chr2:28866719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C32
`Chr2:28866740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C49
`Chr2:28866742`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A13,B10,B105,B128,B129,B134,B47,B61,B64,B73,B79,B8,B81,C15,C29,C31,C35,C38,C47,C55,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791118.1

287 aa

144

287

Transpos_assoc

Yae1_N

PF13963 Transpos_assoc 3-75 aa PF09811 Yae1_N 169-207 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791118.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	3	75	3.7e-21	75.8	Transposase-associated domain
`XP_057791118.1`	Pfam	`PF09811`	Yae1_N	Family	169	207	4.2e-07	30.2	Essential protein Yae1, N terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935135.1
ATGGATAAAGGTTGGATGTCCAAAAATAGATTATCAAACGAGTACGAAGTAGGAGTGGAGTCTTTCTTGCAGTTTGCCGTTAAAAATGGGAAAAATCCCAATGCTATGCCTTGTCCTTGTGTCAAGTGTGGCAATCTACGCGAGAAGGATGTCAAAACCATAAGAGCGCATCTCACATATAATGGCATGGATTTAACATACGTTAGTTGGATTTTTCATGGGGAGAGAAGTAGACCTAACACAAGCAATAAAGAAGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008244
ATGGATAAAGGTTGGATGTCCAAAAATAGATTATCAAACGAGTACGAAGTAGGAGTGGAGTCTTTCTTGCAGTTTGCCGTTAAAAATGGGAAAAATCCCAATGCTATGCCTTGTCCTTGTGTCAAGTGTGGCAATCTACGCGAGAAGGATGTCAAAACCATAAGAGCGCATCTCACATATAATGGCATGGATTTAACATACGTTAGTTGGATTTTTCATGGGGAGAGAAGTAGACCTAACACAAGCAATAAAGAAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791118.1
MDKGWMSKNRLSNEYEVGVESFLQFAVKNGKNPNAMPCPCVKCGNLREKDVKTIRAHLTYNGMDLTYVSWIFHGERSRPNTSNKEEEESSVGHDFYSDEPVDMVHDAYVDNPTHFHRLLEEAEMPLYYSSSFCSMIDLHNYFPKSFWIDAIEDIFDSSLNLEDSHLREGYDEGYADGIISGKGEGQQVGLKTGFETGEELGFYRGCVAVWSSAIRADPNFMSARIQKTIKQMDELLRNYPMLEPENESVSDAMDALRLKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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