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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001555`

染色体: Chr02 坐标: 28857782-28868220 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001555`
名称	SmilChr02G001555
描述	uncharacterized SmilChr02G001555
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28857782 - 28868220 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008245`
GeneID	`131008245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008245`
原始查询	`LOC131008245`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791119.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791119.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791119.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791119.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791119.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28867389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B22
`Chr2:28867491`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	46	A10,A14,A18,A4,A9,B100,B104,B106,B111,B118,B12,B133,B19,B28,B30,B44,B48,B5,B50,B60,B69,B71,B78,B85,B88,B94,B98,C13,C15,C17,C23,C26,C35,C41,C42,C48,C50,C58,C61,C62,C63,C70,C73,C81,C87,D5
`Chr2:28867510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B32,B67,B8,C37
`Chr2:28867514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:28867539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:28867551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B83,C15,C3,C52
`Chr2:28867661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	57	A10,A15,A18,A2,A23,A4,A5,A7,B1,B101,B104,B114,B117,B118,B122,B137,B19,B20,B21,B3,B30,B31,B41,B45,B56,B57,B59,B61,B66,B69,B7,B77,B80,B90,B92,B94,B96,C1,C12,C16,C20,C29,C49,C5,C51,C6,C61,C64,C66,C74,C8,C82,C84,C9,D11,D7,D8
`Chr2:28867699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C43
`Chr2:28867712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B14,C72,D9
`Chr2:28867712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C72,D9
`Chr2:28867723`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr2:28867723`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791119.1

201 aa

100

201

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 2-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791119.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	2	120	1.1e-10	42.6	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935136.1
ACACTTGCTTTTGAGCATATACGTATTTTCATCTTCAGCCACTTAATTTCTCTTTTCCTTTTTCAGCCCCATGATTTTACTCTTCAGCCACAAATTTTTTGATATTTTCATGTATCGATTAAACCTGATCTTGAAAAACATTCAATCTTGAACAGCAAGTTCAATTACTCAGCCACATATTTCACTTTCAAATTCTTGAAGAGCAAGTAATTTATCCTATTTAAACCCCACTTTATCATCTCTCAATTCAGAAGCAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008245
ATGTCAGAAGAATCTCGGAAAAAAAGCAAAGAGCTAACGGCGACGCGAAGACAAAATGTATATCCTCATCATGTTTCGCGCAAGGGATATGCCGGCTTACGGGAAGAAATGAAGGAGCAATTGACAGGTGATTATGAATCTGATAGAACACTTTTGTGGAAGCAAGCACGAGCAAACAAGAAAGGGGAATTTGAGGGTGAAATGTTGATAGAAACAGTTTCAAAGATTGATGTTTACCTACGACAAAAGCATGATGGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791119.1
MSEESRKKSKELTATRRQNVYPHHVSRKGYAGLREEMKEQLTGDYESDRTLLWKQARANKKGEFEGEMLIETVSKIDVYLRQKHDGVFTSSGPSDDVLTQAIGKPEQRGRVRGVGAYVTPTTYYKKSESEKGNEVQEMKKQMAEMNAKILELQQQMMMNKESEEKGSCSVKNEHCVEVDDDVEEVPRDNVLSLVKTPRTKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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