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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001562`

染色体: Chr02 坐标: 28893033-28895362 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001562`
名称	SmilChr02G001562
描述	uncharacterized SmilChr02G001562
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28893033 - 28895362 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008247`
GeneID	`131008247`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008247`
原始查询	`LOC131008247`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=58.4; qcov=0.36; evalue=6.36e-67; confidence=low
Rice	`Os08g0106900` - identity=41; qcov=0.68; evalue=4.34e-77; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008247

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791121.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057791121.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791121.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791121.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791121.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28893087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C25
`Chr2:28893228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B139,B61,B86
`Chr2:28893281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:28893290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B35,B61,B83
`Chr2:28893296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B61,B78
`Chr2:28893325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B7,B84,D10
`Chr2:28893333`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A14,A18,A2,A20,A24,A3,A7,A9,B100,B105,B109,B121,B124,B14,B2,B22,B24,B31,B40,B5,B67,B68,B8,B83,B87,C43,C48,C59,C62,C7,C78,C79,C8,D1,D10,D11,D2,D5
`Chr2:28893340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,C3,C5,C74
`Chr2:28893359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C10,C59,C8
`Chr2:28893360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr2:28893362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C3
`Chr2:28893397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C12,C5,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791121.1

528 aa

264

528

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 192-254 aa PF01609 DDE_Tnp_1 284-428 aa PF13359 DDE_Tnp_4 290-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791121.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	192	254	3.5e-13	49.9	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057791121.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	284	428	1.6e-07	32.0	Transposase DDE domain
`XP_057791121.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	290	451	1.2e-22	80.9	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935138.1
ATGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTATGACAACAACGCTAAAAAGTTCACGGCCCCGAATGAAGTTTGGGATGCATACTGTCAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTGCGCCATGGGAATTATCCGGATTATGAAGACTTGGAAATTGCTATTGGGAACGGTGTGGCGGTAGGGAAAAACTCAATTGGATTGGGTAGTGCTACTGATGCTAGGACACTAGGAGCTGATGAAAATAGAGTTCCGCACATAGAGGAGTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008247
ATGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTATGACAACAACGCTAAAAAGTTCACGGCCCCGAATGAAGTTTGGGATGCATACTGTCAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTGCGCCATGGGAATTATCCGGATTATGAAGACTTGGAAATTGCTATTGGGAACGGTGTGGCGGTAGGGAAAAACTCAATTGGATTGGGTAGTGCTACTGATGCTAGGACACTAGGAGCTGATGAAAATAGAGTTCCGCACATAGAGGAGTTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791121.1
MKFNSGFGYDNNAKKFTAPNEVWDAYCQAHPKDAYLRHGNYPDYEDLEIAIGNGVAVGKNSIGLGSATDARTLGADENRVPHIEELHYDTETEAFVGLTQDDPPSFGSKSPLVFSEVSVESTQRRAPAKRSRGQFEINAGHTENSSHQEFMAEIKPLDKIENEIEDEMEDELDDEIDTKMELEFCDQVRLLMEATKIIREKTHVQDTRYTTVEEMVATFLIIVGHNDRYCNVRQRFDRSHFATSRNFNKILRALNTIAPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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