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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001604`

染色体: Chr02 坐标: 29879138-29879524 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001604`
名称	SmilChr02G001604
描述	uncharacterized SmilChr02G001604
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	29879138 - 29879524 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008262`
GeneID	`131008262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008262`
原始查询	`LOC131008262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=low
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=53.5; qcov=0.555; evalue=6.1e-19; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=52.3; qcov=0.508; evalue=2.27e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791134.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057791134.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791134.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791134.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791134.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:29879141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C37,C49
`Chr2:29879145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,C32,C68,C81,D4
`Chr2:29879171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A6,A7,A8,B10,B110,B127,B132,B134,B18,B19,B2,B25,B26,B31,B37,B48,B60,B63,B80,B86,B9,B99,C10,C22,C26,C28,C35,C37,C41,C49,C54,C71,C75,C87,D10
`Chr2:29879181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C76
`Chr2:29879198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	165	A1,A10,A11,A15,A18,A19,A20,A21,A23,A24,A3,A4,A8,A9,B1,B101,B102,B103,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B115,B118,B119,B12,B121,B125,B127,B129,B131,B132,B134,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B20,B21,B23,B25,B26,B29,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B5,B51,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B61,B62,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B76,B77,B78,B79,B82,B84,B85,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C19,C21,C22,C24,C26,C27,C29,C30,C33,C34,C36,C37,C4,C40,C41,C42,C44,C45,C46,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C66,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C80,C81,C84,C85,C86,C87,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr2:29879216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B138,B14,B2,B48,B9,C71,D10
`Chr2:29879228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B75,C60
`Chr2:29879248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,D11
`Chr2:29879250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C60
`Chr2:29879257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	64	A14,A20,A22,A23,A3,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B106,B109,B110,B121,B124,B127,B132,B14,B18,B19,B22,B24,B25,B26,B31,B37,B40,B55,B6,B60,B63,B68,B83,B86,B87,B9,B99,C10,C22,C26,C28,C34,C35,C40,C41,C48,C49,C57,C6,C62,C63,C7,C75,C78,C79,C8,C87,D1,D10,D11,D2,D5,D9
`Chr2:29879335`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B113
`Chr2:29879335`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791134.1

128 aa

128

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 3-65 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791134.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	3	65	2.1e-21	77.2	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935151.1
ATGGACGCAAAGAGTAAAAGATTCAAGCTGATGCAGGAAGAGGCTCGCAAGGACATCGAACGAGCTTTCGGCGTGCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCATCAAAGGACTACCGCGTCTTTGGAAGAATAAGGAGTTGAGCGACATCATGTTCACGTGCATCGTTTTGTACAATATGATCATCCAAGACGAAGACGAACACACAACAGAATGGGAAGAAGAGGTCACCGACGAAGCTTCGAGTAGCTCAGCTGCAGCTCATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008262
ATGGACGCAAAGAGTAAAAGATTCAAGCTGATGCAGGAAGAGGCTCGCAAGGACATCGAACGAGCTTTCGGCGTGCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCATCAAAGGACTACCGCGTCTTTGGAAGAATAAGGAGTTGAGCGACATCATGTTCACGTGCATCGTTTTGTACAATATGATCATCCAAGACGAAGACGAACACACAACAGAATGGGAAGAAGAGGTCACCGACGAAGCTTCGAGTAGCTCAGCTGCAGCTCATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791134.1
MDAKSKRFKLMQEEARKDIERAFGVLQARWAIIKGLPRLWKNKELSDIMFTCIVLYNMIIQDEDEHTTEWEEEVTDEASSSSAAAHPRTGAPSEFRAYVARQAYARPGDACPPDFRFEGAHLVSFWSD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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