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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001629`

染色体: Chr02 坐标: 30256658-30258988 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001629`
名称	SmilChr02G001629
描述	uncharacterized SmilChr02G001629
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	30256658 - 30258988 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008272`
GeneID	`131008272`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008272`
原始查询	`LOC131008272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0433800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0433800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=29.8; qcov=0.323; evalue=5.22e-11; confidence=low
Rice	`Os11g0433800` - identity=55.4; qcov=0.193; evalue=6.45e-20; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008272

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791141.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791141.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791141.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791141.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:30256770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B137,B33,B79,C36
`Chr2:30256796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B130,B19,B33
`Chr2:30256796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B19,B33
`Chr2:30256816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B138,C39
`Chr2:30256846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A16,C17,C30
`Chr2:30256846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C17,C30
`Chr2:30256847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B138,C3,C39
`Chr2:30256854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B21,B60,C71
`Chr2:30256870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B91
`Chr2:30256908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,C79,D11
`Chr2:30256950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:30256978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A20,B129,B137,B33,B6,B75,B79,B91,C36,C60,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791141.1

384 aa

192

384

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 303-349 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791141.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	303	349	3.5e-16	60.2	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935158.1
ATGGATCGAGGCAATTTCAATAGAGACCACTCTTGCTATTATTTGTTTCTCTATTCCTTCTTCAACTCTCAAAATTTCAACCCCTCCCAAGACTATTATCCAAATCTTGCTGATATTCCAAGCTCCAATGAATTTTCAGAGTTTGATTATGCTATGAATTCAGAATTCTCGATTAATCCAACTGATTCTCCTATTTCTGAATATCACCAAACCTCTGAAATTTTTTCTGGAAACCCTTCCAACAATGCGCATAGTTGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008272
ATGGATCGAGGCAATTTCAATAGAGACCACTCTTGCTATTATTTGTTTCTCTATTCCTTCTTCAACTCTCAAAATTTCAACCCCTCCCAAGACTATTATCCAAATCTTGCTGATATTCCAAGCTCCAATGAATTTTCAGAGTTTGATTATGCTATGAATTCAGAATTCTCGATTAATCCAACTGATTCTCCTATTTCTGAATATCACCAAACCTCTGAAATTTTTTCTGGAAACCCTTCCAACAATGCGCATAGTTGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791141.1
MDRGNFNRDHSCYYLFLYSFFNSQNFNPSQDYYPNLADIPSSNEFSEFDYAMNSEFSINPTDSPISEYHQTSEIFSGNPSNNAHSWTDIEDISLMSAWCFISNNPIVGRNRNSKSFWKSVAGMYEQSRADNPEIRGPRTLESLRQRFKRLNKNVTLWVAAYKKAYERRTSGQSKEDIEKAAQTIYGKTKFTHEVFEKVMSNCPNWELKLESTGYVRRSHPDDEDSVDESRSSLKKSRTDEDVNPPTDSTPETPGSDASKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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