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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001680`

染色体: Chr02 坐标: 31023295-31026036 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001680`
名称	SmilChr02G001680
描述	uncharacterized SmilChr02G001680
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31023295 - 31026036 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008289`
GeneID	`131008289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008289`
原始查询	`LOC131008289`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF2921 family protein, putative (DUF2921) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828257]; symbol=AT4G21700; hit=AT4G21700; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF2921 family protein, putative (DUF2921) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828257]; symbol=AT4G21700; hit=AT4G21700; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G21700` (AT4G21700) DUF2921 family protein, putative (DUF2921) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828257] identity=35.7; qcov=1.07; evalue=3.1e-166; confidence=medium
Rice	`Os05g0557500` - identity=45.3; qcov=0.452; evalue=2.47e-111; confidence=medium
GO	GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	PF11145 (DUF2921); PF25333 (DUF2921_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791159.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791159.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791159.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791159.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791159.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31023349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B70,C62
`Chr2:31023367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B70,C62
`Chr2:31023443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B135,B20,C49
`Chr2:31023478`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A14,B42,C43
`Chr2:31023478`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A14,B42,C43
`Chr2:31023552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr2:31024123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr2:31024139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C17
`Chr2:31024139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:31024224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	120	A1,A11,A13,A16,A18,A19,A2,A22,A25,A4,A6,A7,A8,B1,B101,B102,B105,B109,B110,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B129,B13,B132,B134,B135,B139,B15,B18,B19,B21,B25,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B37,B40,B41,B42,B43,B45,B47,B49,B50,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B66,B69,B7,B70,B71,B73,B75,B76,B78,B79,B80,B81,B82,B86,B89,B9,B94,B97,B98,B99,C10,C15,C16,C17,C22,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C35,C38,C39,C4,C41,C43,C47,C50,C51,C52,C54,C55,C6,C60,C61,C62,C63,C75,C76,C79,C80,C83,C85,C86,C87,D10
`Chr2:31024282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:31024610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791159.1

913 aa

456

913

DUF2921_N

DUF2921

PF25333 DUF2921_N 33-209 aa PF25333 DUF2921_N 238-387 aa PF25333 DUF2921_N 422-615 aa PF11145 DUF2921 628-898 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791159.1`	Pfam	`PF25333`	DUF2921_N	Domain	33	209	9.6e-51	173.8	DUF2921 lipocalin-like domain
`XP_057791159.1`	Pfam	`PF25333`	DUF2921_N	Domain	238	387	9.6e-51	173.8	DUF2921 lipocalin-like domain
`XP_057791159.1`	Pfam	`PF25333`	DUF2921_N	Domain	422	615	9.6e-51	173.8	DUF2921 lipocalin-like domain
`XP_057791159.1`	Pfam	`PF11145`	DUF2921	Repeat	628	898	3e-64	217.6	Transmembrane E3 ligase/DUF2921 transmembrane domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935176.1
ATGTCGTGTTCATGGTTTCGCTACTTATCTTTCTTCTTTCTCTTGGCTTCTATTTGCACAAATCATGCCTTTTCTAAATCCGGAAACGATGACTTTTATTCCAAACACTGTGCTTCTGTACTTCCTCCTTATGATACCACCTCACGTAGTCGTAGCTTGGACGACTCTCTACCTTTCCTCTCCACACCCTACTTCACCGGCGGCGGCAGCCTTCTACGCGTGGAACCAAACCGGACCTACTACTACGTGCAGAAGAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008289
ATGTCGTGTTCATGGTTTCGCTACTTATCTTTCTTCTTTCTCTTGGCTTCTATTTGCACAAATCATGCCTTTTCTAAATCCGGAAACGATGACTTTTATTCCAAACACTGTGCTTCTGTACTTCCTCCTTATGATACCACCTCACGTAGTCGTAGCTTGGACGACTCTCTACCTTTCCTCTCCACACCCTACTTCACCGGCGGCGGCAGCCTTCTACGCGTGGAACCAAACCGGACCTACTACTACGTGCAGAAGAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791159.1
MSCSWFRYLSFFFLLASICTNHAFSKSGNDDFYSKHCASVLPPYDTTSRSRSLDDSLPFLSTPYFTGGGSLLRVEPNRTYYYVQKNLRLRLQPNCYQTTATGVYKVDGFLYIRSSYSDDDVHSNYSYSGYNRRRNRSNGSIKFSMSGFWSKKSRKLCMIGSSLWKGVDRDAVLKLKFDDGENPTVYTSVVSGSLESTASANDPRYFAPILIFSFPEVSNYNYSLLKEEVWGAFPSRKGESLSLDAAEFCSVMRRGPRSLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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