当前解析结果
SmilChr02G001681| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001681 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001681 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001681 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 31050762 - 31051106 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008290 |
|---|---|
| GeneID | 131008290 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008290 |
| 原始查询 | LOC131008290 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008290 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791161.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057791161.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791161.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791161.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791161.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:31050873 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B19 |
Chr2:31050874 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C20 |
Chr2:31050905 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B47,D1 |
Chr2:31050916 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B135,B98,C58,D11,D6 |
Chr2:31050918 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr2:31050951 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 42 | A1,A10,A14,A24,B1,B115,B120,B122,B129,B131,B14,B2,B27,B28,B30,B33,B37,B41,B46,B50,B59,B75,B83,B85,B9,C10,C16,C29,C3,C32,C38,C48,C58,C59,C68,C79,C8,C85,C87,D3,D4,D7 |
Chr2:31050996 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B29,C40,C8,D7 |
Chr2:31051004 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B54,C58 |
Chr2:31051016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B115,B58,B78 |
Chr2:31051018 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A22,B37,B6,C63 |
Chr2:31051028 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B80,C30,C41,C71 |
Chr2:31051050 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B59,C30,C41,C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。