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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001684`

染色体: Chr02 坐标: 31070324-31073074 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001684`
名称	SmilChr02G001684
描述	uncharacterized SmilChr02G001684
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31070324 - 31073074 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008291`
GeneID	`131008291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008291`
原始查询	`LOC131008291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF2921 family protein, putative (DUF2921) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828257]; symbol=AT4G21700; hit=AT4G21700; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF2921 family protein, putative (DUF2921) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828257]; symbol=AT4G21700; hit=AT4G21700; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G21700` (AT4G21700) DUF2921 family protein, putative (DUF2921) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828257] identity=35.4; qcov=1.03; evalue=1.67e-160; confidence=medium
Rice	`Os05g0557500` - identity=46.4; qcov=0.428; evalue=2.54e-108; confidence=low
GO	GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	PF11145 (DUF2921); PF25333 (DUF2921_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791162.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791162.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791162.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791162.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791162.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31070472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B104,B20,C49
`Chr2:31070519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B98
`Chr2:31070575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr2:31070821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:31070882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B98
`Chr2:31070957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B137,B91,C46,C5
`Chr2:31070964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B137,B91,C46,C5
`Chr2:31070971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:31071011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B21,C14,C55
`Chr2:31071147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B140,B21,C14,C55
`Chr2:31071318`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr2:31071318`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791162.1

916 aa

458

916

DUF2921_N

DUF2921

PF25333 DUF2921_N 33-207 aa PF25333 DUF2921_N 232-385 aa PF25333 DUF2921_N 419-618 aa PF11145 DUF2921 631-901 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791162.1`	Pfam	`PF25333`	DUF2921_N	Domain	33	207	7.3e-54	184.0	DUF2921 lipocalin-like domain
`XP_057791162.1`	Pfam	`PF25333`	DUF2921_N	Domain	232	385	7.3e-54	184.0	DUF2921 lipocalin-like domain
`XP_057791162.1`	Pfam	`PF25333`	DUF2921_N	Domain	419	618	7.3e-54	184.0	DUF2921 lipocalin-like domain
`XP_057791162.1`	Pfam	`PF11145`	DUF2921	Repeat	631	901	3.7e-64	217.3	Transmembrane E3 ligase/DUF2921 transmembrane domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935179.1
ATGCCGTATTCATGGTTTCGCTCCTTATCTTTCTTCTTTCTCTTGGCTTTTATTTGTACAAATCATGCCTTTTCTAAATCCGAAAACGATGACTTTTATTCCAAACACTGTTCATCTGTGCTTCCTCCTTATGATACCACCTCTCATATCTTGGACGACTCTCTACCTTTCCTCTCCACACCCTACTTCACCGGCGGCGGCAGCCTTCTACGCTTGGAACCAAACCGGACCTACTACTACGTGCAGAAGAATCTGAGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008291
ATGCCGTATTCATGGTTTCGCTCCTTATCTTTCTTCTTTCTCTTGGCTTTTATTTGTACAAATCATGCCTTTTCTAAATCCGAAAACGATGACTTTTATTCCAAACACTGTTCATCTGTGCTTCCTCCTTATGATACCACCTCTCATATCTTGGACGACTCTCTACCTTTCCTCTCCACACCCTACTTCACCGGCGGCGGCAGCCTTCTACGCTTGGAACCAAACCGGACCTACTACTACGTGCAGAAGAATCTGAGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791162.1
MPYSWFRSLSFFFLLAFICTNHAFSKSENDDFYSKHCSSVLPPYDTTSHILDDSLPFLSTPYFTGGGSLLRLEPNRTYYYVQKNLRLRLQPNCYQTTATGVYKVDGFLYIRSSYSSDDVHSNYSYSGYNRRRNRSNGSIKFSMSGFWSEKSRKLCMIGSSLWRGVDRDAVLKLKFDDGENPTVYTGVVSGSLESTASANDPRYFAPILFFSFPEVSNYNYSLLKEEVWGAFPSRKGESQSLDAAEFCSVMRRGLRSLELE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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