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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001717`

染色体: Chr02 坐标: 31626175-31626906 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001717`
名称	SmilChr02G001717
描述	uncharacterized SmilChr02G001717
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31626175 - 31626906 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008300`
GeneID	`131008300`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008300`
原始查询	`LOC131008300`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=47.6; qcov=0.328; evalue=2.78e-16; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=56.6; qcov=0.984; evalue=7.74e-74; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008300

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791171.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057791171.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791171.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791171.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791171.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31626181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B132
`Chr2:31626183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A9,B95,C14,D1
`Chr2:31626189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:31626200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr2:31626201`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A5,B106,B12,B122,B123,B124,B3,B33,B41,B63,B94,B98,C11,C17,C22,C29,C33,C39,C41,C47,C54,C58,C65,C80
`Chr2:31626213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A14,A23,A25,A8,B110,B121,B126,B132,B138,B15,B18,B19,B25,B31,B32,B55,B60,B81,B84,B86,B9,B99,C10,C26,C28,C3,C35,C37,C41,C6,C66,C73,C75,C78,C84,C85,C87,D4
`Chr2:31626219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A23,A3,A4,B101,B106,B109,B125,B126,B135,B20,B24,B35,B5,B51,B52,B53,B62,B67,B72,B81,B9,C12,C20,C21,C29,C3,C31,C51,C57,C59,C69,C70,C76,D3
`Chr2:31626231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B32,B50,B87,C66
`Chr2:31626231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B50,B87,C66
`Chr2:31626240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C59,C79
`Chr2:31626247`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr2:31626247`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791171.1

192 aa

192

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 32-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791171.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	32	192	1.1e-71	241.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935188.1
ATGCGAAGAGACTTATTTGTCAAGATCGTTGATGCGATGAGCAACTACTCACCCTTTTTCACATTGAGGAGTATGATTACCATTTATGGTGATCGATATTTGAGGACTCCAAATGCAGCAGATACTGAACGCTTGCTACAGATGCATGAAGAAATACATGGCTTCCCGGGAATGCTGGGAAGCCTTGATTGCATGCATTGGGAGTGGAGGAATTGTCCAGTCGCATACAAAGGATACTACACACGAGGCGATCACGGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008300
ATGCGAAGAGACTTATTTGTCAAGATCGTTGATGCGATGAGCAACTACTCACCCTTTTTCACATTGAGGAGTATGATTACCATTTATGGTGATCGATATTTGAGGACTCCAAATGCAGCAGATACTGAACGCTTGCTACAGATGCATGAAGAAATACATGGCTTCCCGGGAATGCTGGGAAGCCTTGATTGCATGCATTGGGAGTGGAGGAATTGTCCAGTCGCATACAAAGGATACTACACACGAGGCGATCACGGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791171.1
MRRDLFVKIVDAMSNYSPFFTLRSMITIYGDRYLRTPNAADTERLLQMHEEIHGFPGMLGSLDCMHWEWRNCPVAYKGYYTRGDHGVPTIVLEAVASADLWIWHAFFGVAGASNDINVLHGSPLFNQFLHGNTPPVQFTVNGRTYNKGYYLTDGIYPTWASFVKSYPAPGDPMRQKFAQRQEAARKDIEHVF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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