当前解析结果
SmilChr02G001723| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001723 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001723 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G001723 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 31699763 - 31700811 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008304 |
|---|---|
| GeneID | 131008304 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008304 |
| 原始查询 | LOC131008304 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008304 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057791175.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057791175.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057791175.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791175.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791175.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:31699836 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B135 |
Chr2:31699842 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:31699845 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B40 |
Chr2:31699845 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr2:31699925 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,B12,B139,B78,C53 |
Chr2:31699929 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr2:31699956 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,C76,C86 |
Chr2:31700067 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | A3,B23,B4,B82,C27,C44,C76,C81,C86 |
Chr2:31700097 |
C |
CAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 33 | A14,A20,B108,B111,B12,B120,B124,B134,B135,B139,B140,B2,B22,B3,B31,B43,B44,B48,B52,B59,B61,B65,B7,B84,B97,C17,C29,C37,C70,C78,C81,D4,D7 |
Chr2:31700185 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:31700190 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr2:31700215 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B103,C1,C15 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。