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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002495`

染色体: Chr01 坐标: 42711485-42712389 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002495`
名称	SmilChr01G002495
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42711485 - 42712389 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008307`
GeneID	`131008307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008307`
原始查询	`LOC131008307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=37.4; qcov=0.837; evalue=3.38e-54; confidence=medium
Rice	`Os08g0125300` - identity=51.2; qcov=0.99; evalue=4.67e-92; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791180.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791180.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791180.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791180.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791180.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42711539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:42711541`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A11,A20,A23,A3,A8,B101,B117,B18,B2,B3,B40,B48,B52,B73,B81,C1,C16,C18,C24,C34,C49,C52,C56,C6,C62,C80,D8,D9
`Chr1:42711595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:42711598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D3
`Chr1:42711598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:42711599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B83,C35,C64,C67,C80
`Chr1:42711602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C64,C80
`Chr1:42711635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B56,B82,B96,C65
`Chr1:42711641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B34,B36,C7
`Chr1:42711653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B74
`Chr1:42711676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:42711713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B135,B58,C34,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791180.1

294 aa

147

294

RVT_2

PF07727 RVT_2 1-56 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791180.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	1	56	1.6e-09	38.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935197.1
TTGAGGAGTTCAAGAAGGCCATGTCAAAGGAGTTTGAGATGACAGACATTGGGCTGATGGCGTACTACCTCGGCGTGGAAGTCAAGCAACTCGAAGATGGGATCTTCATCACACAAGAAGGTTACGCCAAGGAAATTCTCAAGAAGTTCAAGATGGAGGACTGCAAGGCAATCAACACACCAGTGGAGTGTGGGATCAAATTATCCAAAAACGTCGGAGGAGAAAAAGTGGACCCGACATTGTTCAAGAGCTTGGTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008307
ATGTCAAAGGAGTTTGAGATGACAGACATTGGGCTGATGGCGTACTACCTCGGCGTGGAAGTCAAGCAACTCGAAGATGGGATCTTCATCACACAAGAAGGTTACGCCAAGGAAATTCTCAAGAAGTTCAAGATGGAGGACTGCAAGGCAATCAACACACCAGTGGAGTGTGGGATCAAATTATCCAAAAACGTCGGAGGAGAAAAAGTGGACCCGACATTGTTCAAGAGCTTGGTTGGAAGTTTACGGTACTTAACTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791180.1
MSKEFEMTDIGLMAYYLGVEVKQLEDGIFITQEGYAKEILKKFKMEDCKAINTPVECGIKLSKNVGGEKVDPTLFKSLVGSLRYLTCTRPDILYATGLVSRYMENPTTTHFKAAKRILRYLKGTLDYGLFYSNTHDYKLVGYSDSDWAGDNDGRKSTSGFVFFMGDTAFTWMSKKQPIVTLSTCEAEYVAATSSVCHAVWLRSLLEELGWPQKEPTTICVDNKSAIALSKNPVFHNRSKHIDTRFHYIRECIAKKEVQVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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