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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001737`

染色体: Chr02 坐标: 31944839-31945528 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001737`
名称	SmilChr02G001737
描述	uncharacterized SmilChr02G001737
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31944839 - 31945528 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008308`
GeneID	`131008308`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008308`
原始查询	`LOC131008308`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794]; symbol=AT2G02650; hit=AT2G02650; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=29.7; qcov=0.781; evalue=4.17e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=24.8; qcov=0.934; evalue=1.63e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008308

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791178.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791178.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057791178.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791178.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791178.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31944881`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A3,B120,B132,B83,B94,C24,C34,C49,C56,C86,D6
`Chr2:31945137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr2:31945137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:31945147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B18,B5,B96
`Chr2:31945147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B5,B96
`Chr2:31945158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr2:31945162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:31945171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B77,C25,C34,D8
`Chr2:31945184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A14,A15,A19,A21,A25,A8,B102,B108,B122,B123,B124,B133,B137,B139,B14,B24,B32,B34,B38,B39,B49,B53,B59,B63,B75,B8,B83,B86,B87,B97,C13,C18,C22,C25,C34,C42,C44,C50,C63,C79
`Chr2:31945206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C10,C31
`Chr2:31945226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:31945268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C49,C70,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791178.1

151 aa

151

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 6-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791178.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	6	69	2.4e-12	48.1	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935195.1
ATGGCGAAGATTGGCGAGCAGATGCGCCCACAGAAAGCTAAAGTCACGGCATGGCGAGCGCTCAGAGATAGATTACCGACGTGTGCAAACTTGAGAAAGAGAAATATCATGATCGATGAAGTTGAGATGAACTGTAACGCATGCTTCGAATCAGTTGAGGACATTAACCATACTCTTCTCTGTTGTCCGAAGGCTTCGGCAATTTGGGATGGTATCTCAAGGTGGATTGGTTTCCAAACGGCCCGACCGCAAGTCGTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008308
ATGGCGAAGATTGGCGAGCAGATGCGCCCACAGAAAGCTAAAGTCACGGCATGGCGAGCGCTCAGAGATAGATTACCGACGTGTGCAAACTTGAGAAAGAGAAATATCATGATCGATGAAGTTGAGATGAACTGTAACGCATGCTTCGAATCAGTTGAGGACATTAACCATACTCTTCTCTGTTGTCCGAAGGCTTCGGCAATTTGGGATGGTATCTCAAGGTGGATTGGTTTCCAAACGGCCCGACCGCAAGTCGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791178.1
MAKIGEQMRPQKAKVTAWRALRDRLPTCANLRKRNIMIDEVEMNCNACFESVEDINHTLLCCPKASAIWDGISRWIGFQTARPQVVQDHYLALSHLGNGKKSKKFLKSLWVCTVWILWRHRNASRFDRKGWDIPEVENLEIEDIVGEVEID

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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