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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001741`

染色体: Chr02 坐标: 31990017-31996392 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001741`
名称	SmilChr02G001741
描述	uncharacterized SmilChr02G001741
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31990017 - 31996392 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008309`
GeneID	`131008309`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008309`
原始查询	`LOC131008309`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=25.3; qcov=0.777; evalue=9.84e-06; confidence=low
Rice	`Os10g0351414` - identity=30.8; qcov=0.691; evalue=2.24e-16; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008309

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791179.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791179.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791179.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791179.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791179.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31990111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	B109,B110,B111,B138,B140,B18,B28,B35,B36,B48,B51,B62,B67,B7,B84,B88,B90,B92,B94,B95,C14,C15,C16,C17,C19,C21,C26,C42,C45,C54,C64,C66,C70,C73,D1,D10,D11,D2,D4,D7
`Chr2:31990167`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	B109,B110,B111,B138,B140,B18,B28,B36,B51,B62,B67,B7,B84,B88,B90,B92,B94,B95,C14,C15,C16,C19,C21,C26,C42,C45,C54,C64,C66,C70,C73,D1,D10,D11,D2,D4,D7
`Chr2:31990169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	95	A1,A14,A16,A18,A21,A4,A5,A9,B10,B102,B103,B106,B11,B114,B115,B119,B120,B121,B123,B125,B128,B130,B133,B134,B136,B137,B139,B16,B17,B2,B27,B3,B33,B34,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B46,B47,B5,B52,B54,B59,B6,B63,B66,B70,B73,B76,B77,B8,B80,B83,B85,B86,B87,B99,C10,C11,C17,C18,C23,C25,C3,C31,C33,C37,C38,C39,C41,C43,C44,C46,C47,C50,C52,C53,C55,C57,C60,C61,C65,C67,C69,C75,C77,C79,C80,C83,C87,C9,D8
`Chr2:31990220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C33
`Chr2:31990227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,D10
`Chr2:31990318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr2:31990324`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	B121,B128,B27,B38,B44,B62,B85,C11,C25,C31,C44,C67,C69,C73,C79,C80,C83,C9,D8
`Chr2:31990350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:31990401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	B109,B110,B111,B138,B140,B18,B28,B35,B36,B48,B51,B62,B67,B7,B84,B88,B90,B92,B94,B95,C14,C15,C16,C17,C19,C21,C26,C42,C45,C54,C64,C66,C73,D1,D10,D11,D2,D4,D7
`Chr2:31990402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	121	A1,A18,A20,A23,A3,A6,A8,A9,B1,B102,B103,B105,B107,B109,B110,B111,B118,B120,B124,B13,B132,B137,B138,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B22,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B31,B33,B35,B36,B38,B39,B41,B48,B49,B51,B52,B54,B59,B60,B61,B62,B63,B67,B68,B69,B7,B75,B79,B80,B83,B84,B86,B88,B9,B90,B92,B94,B95,B97,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C21,C24,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C34,C35,C36,C41,C42,C45,C47,C51,C54,C56,C57,C58,C6,C60,C64,C66,C7,C70,C73,C74,C75,C79,C83,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D6,D7,D9
`Chr2:31990426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A10,A2,A22,A7,B1,B104,B117,B122,B138,B30,B32,B37,B41,B6,B69,B77,B85,B87,B93,C16,C29,C33,C49,C55,C6,C61,C63,C7,C84,C85
`Chr2:31996271`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A1,A16,A18,A20,A23,A8,A9,B1,B102,B110,B13,B132,B137,B14,B17,B19,B24,B25,B26,B31,B33,B38,B52,B59,B60,B61,B63,B68,B7,B83,B9,B92,B97,B99,C19,C24,C30,C34,C35,C36,C41,C47,C51,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C74,C75,C83,C87,D4,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791179.1

188 aa

188

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 66-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791179.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	66	177	1.8e-06	28.6	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935196.1
ATGCCGCCGGTAAACGTTGCCATTGATTGGCAGACCTTTGCCGGACGTTACCGGCGGCAATTGTCGTCGGTGATTAGCGCCACCGGTAATGTTCACCGGACGGCGGTGGCGACCCTCGCCGCCGCCGTTTCTGTGGATGATGGAGAACATGAACCTTGGGACTTTTGTGGGGTTTATGGCTGGAGCAATACAGAAGATCACTACTTGACTTGGGACCTTATGATTTCTCTTCTGCCATCAGTCTCTAATAAATGGATTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008309
ATGCCGCCGGTAAACGTTGCCATTGATTGGCAGACCTTTGCCGGACGTTACCGGCGGCAATTGTCGTCGGTGATTAGCGCCACCGGTAATGTTCACCGGACGGCGGTGGCGACCCTCGCCGCCGCCGTTTCTGTGGATGATGGAGAACATGAACCTTGGGACTTTTGTGGGGTTTATGGCTGGAGCAATACAGAAGATCACTACTTGACTTGGGACCTTATGATTTCTCTTCTGCCATCAGTCTCTAATAAATGGATTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791179.1
MPPVNVAIDWQTFAGRYRRQLSSVISATGNVHRTAVATLAAAVSVDDGEHEPWDFCGVYGWSNTEDHYLTWDLMISLLPSVSNKWICGGDFNQTMYHFEKRDGNMKSDYKLVKFRETIETCGLLDLGFVGEPFTWTNNQRGEDNIMERLDRIFGSEGWIAAFPGFEVSHLLRKSSDHCPILLARWWFD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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