当前解析结果
SmilChr02G001800| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001800 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001800 |
| 描述 | uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 32844924 - 32845280 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008321 |
|---|---|
| GeneID | 131008321 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008321 |
| 原始查询 | LOC131008321 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=ATMG00310; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | hit=ATMG00310; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | ATMG00310- identity=28.3; qcov=1.3; evalue=6.16e-11; confidence=low |
| Rice | Os03g0643433- identity=41.7; qcov=0.69; evalue=3.53e-06; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008321 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057791190.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057791190.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057791190.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057791190.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791190.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:32844982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,C56,C65 |
Chr2:32845022 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B135 |
Chr2:32845036 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B129,B91 |
Chr2:32845223 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A15,A4,B122,B45,B56,B96,C4 |
Chr2:32845258 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,C41,D11 |
Chr2:32845260 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B83 |
Chr2:32845260 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。