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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001854`

染色体: Chr02 坐标: 33758878-33760775 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001854`
名称	SmilChr02G001854
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	33758878 - 33760775 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008334`
GeneID	`131008334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008334`
原始查询	`LOC131008334`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-1
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-1
Arabidopsis	`AT4G27290` (AT4G27290) S-locus lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828837] identity=48.7; qcov=0.735; evalue=6.59e-89; confidence=high
Rice	`Os05g0501400` - identity=48.4; qcov=0.726; evalue=7.3e-83; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08276 (PAN_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791200.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791200.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791200.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791200.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:33758920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,D1,D8
`Chr2:33758922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr2:33758925`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr2:33758925`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr2:33758937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:33758964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,C5,C74,C86
`Chr2:33758971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A10,A22,B118,B119,B126,B13,B138,B17,B28,B42,B43,B58,B65,B7,B72,C13,C15,C31,C41,C45,C54,C73,D3
`Chr2:33759100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A10,B112,B118,B12,B126,B130,B136,B138,B139,B48,B7,B72,B75,B77,B78,B83,B90,B92,C13,C15,C21,C23,C30,C33,C41,C45,C54,C73,D3,D4
`Chr2:33759144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A24,A3,B103,B105,B106,B112,B14,B20,B23,B25,B38,B39,B4,B49,B52,B55,B60,B66,B79,B89,B97,C13,C19,C22,C27,C34,C38,C40,C44,C48,C55,C59,C79,C85,D2,D9
`Chr2:33759154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B104,B105,B115,C45
`Chr2:33759155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B78
`Chr2:33759176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B88,C19,C64,C66,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791200.1

427 aa

214

427

PAN_2

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF08276 PAN_2 138-179 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 267-417 aa PF00069 Pkinase 267-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791200.1`	Pfam	`PF08276`	PAN_2	Domain	138	179	1.2e-09	38.9	PAN-like domain
`XP_057791200.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	267	417	1.3e-25	90.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057791200.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	267	425	2.4e-23	83.6	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935217.1
ATGTGTGGCGCATACGACAGTTGCAACGTCGCGGACTCTCCACCCTGTGGATGTCTCGACAGGTTTGTGCATAAGGATCTGGAGAGCTGGAGGCAGATGGATTGGTCCGGATGGGCTGGAAAAAGCCCCGATTCCACCTATAAGAAGAAGAGGAGCCAAACCCTTTCCGAATCATCGCTCCTCATCCTCATCCACGGCTCCACGCCATGTATTACTCTGCATCCAGCAAAGCCAATGCTTTACTTACCATTTTATGTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008334
ATGTGTGGCGCATACGACAGTTGCAACGTCGCGGACTCTCCACCCTGTGGATGTCTCGACAGGTTTGTGCATAAGGATCTGGAGAGCTGGAGGCAGATGGATTGGTCCGGATGGGCTGGAAAAAGCCCCGATTCCACCTATAAGAAGAAGAGGAGCCAAACCCTTTCCGAATCATCGCTCCTCATCCTCATCCACGGCTCCACGCCATGTATTACTCTGCATCCAGCAAAGCCAATGCTTTACTTACCATTTTATGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791200.1
MCGAYDSCNVADSPPCGCLDRFVHKDLESWRQMDWSGWAGKSPDSTYKKKRSQTLSESSLLILIHGSTPCITLHPAKPMLYLPFYVFSGSPQHSPLVRLLLSSFWISNGPSQKVWQGLFQTNPKGSLLATAEVMCSSRRMSLAECEAVCTANCSCAAYARLDVSKERSGCLFYYGDLLEIRVVPMSGQHLYIKMSSTESGSKGKKRVILIPSFASVARISLFLIIILFCTKRMKNRNKRKEGPVAREAKLSFFNLSTILK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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