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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006198`

染色体: Chr01 坐标: 77662004-77666613 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006198`
名称	SmilChr01G006198
描述	alpha-galactosidase 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	77662004 - 77666613 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008343`
GeneID	`131008343`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008343`
原始查询	`LOC131008343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-galactosidase 3-like
产物	alpha-galactosidase 3-like
Arabidopsis	`AT3G56310` (AT3G56310) Melibiase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824798] identity=72; qcov=0.893; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0679300` (alpha-Gal) - identity=68.9; qcov=0.925; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00603 (Glycosphingolipid biosynthesis - globo and isoglobo series - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF16499 (Melibiase_2); PF17801 (Melibiase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008343

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057791213.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791213.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791213.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791213.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791213.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:77664642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C80
`Chr1:77664838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C39,C83
`Chr1:77666032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C39,C83
`Chr1:77666257`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	110	A1,A11,A13,A14,A18,A22,A6,B10,B102,B103,B11,B113,B118,B119,B122,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B20,B22,B24,B30,B32,B33,B38,B40,B41,B42,B43,B44,B47,B49,B51,B53,B55,B58,B6,B60,B62,B64,B67,B68,B69,B71,B72,B77,B82,B84,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B98,C16,C18,C21,C23,C24,C28,C30,C32,C33,C35,C40,C42,C43,C44,C46,C48,C49,C5,C52,C56,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C67,C68,C70,C73,C79,C80,C81,C82,C85,C9,D1,D2,D3,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791213.1

428 aa

214

428

Melibiase_2

Melibiase_C

PF16499 Melibiase_2 63-326 aa PF17801 Melibiase_C 341-418 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791213.1`	Pfam	`PF16499`	Melibiase_2	Family	63	326	1.6e-80	271.2	Alpha galactosidase A
`XP_057791213.1`	Pfam	`PF17801`	Melibiase_C	Domain	341	418	4.1e-19	69.2	Alpha galactosidase C-terminal beta sandwich domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935230.1
GGCTTAAAGTATCTGCAAATTTGATACTATTAATTTTTGTAGGTGGGATGACTGACCACTCACGAGTCACCAACTTACATAAATCTAATCCAAATGAACAATACACTATTCCAATAAAATAAACATGATTTCGAATAATATCTCATGATTAATTCTCTTTATTAATACACTACACACACCCCACATATTTTCCTTGCAGCAACCAACATCTCACTCGACTAGTGTACCAGAAAAAGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGCTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008343
ATGGCGAAGCGCAGTGCTAATTATGTGAGAGGTTGCAGGCTTACAGTTATTCTGTATGTATATGCGGCGGCAGTGGCAGTTACTGCAAGAGTGCTGCCGTTGCATCCGTACTATGATGGCCACCAAAGCAGAATTTATGATACTTCAAAATATGGGATTTTGCAGCTGGGAAATGGTTTGGCTCAAACTCCTCAGATGGGATGGAATAGCTGGAATTACTTCAGATGCGACATTCATGAAAAAGTAATCAGAGAAACAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791213.1
MAKRSANYVRGCRLTVILYVYAAAVAVTARVLPLHPYYDGHQSRIYDTSKYGILQLGNGLAQTPQMGWNSWNYFRCDIHEKVIRETADALVTTGLAKLGYVYVNIDDCWSEVARDSEGDMVPDSKAFPSGLKALADYVHSKGLKIGIYSDAGLHTCQLRPGSLKYENDDAELFASWGIDYLKYDNCFNLGIDPKERFPTMRDALNATGRTIFYSLCEWGLDDPALWASKIGNSWRTTDDIEDTWESMTAIADINDKWAAY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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