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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001881`

染色体: Chr02 坐标: 34127505-34128953 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001881`
名称	SmilChr02G001881
描述	probable NOT transcription complex subunit VIP2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34127505 - 34128953 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008345`
GeneID	`131008345`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008345`
原始查询	`LOC131008345`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable NOT transcription complex subunit VIP2
产物	probable NOT transcription complex subunit VIP2
Arabidopsis	`AT5G59710` (VIP2) VIRE2 interacting protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836092] identity=70.3; qcov=0.532; evalue=4.25e-26; confidence=medium
Rice	`Os12g0500700` - identity=69.1; qcov=0.396; evalue=2.1e-21; confidence=low
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0030904 (retromer complex); GO:0042147 (retrograde transport, endosome to Golgi)
KEGG	-
Pfam	PF03643 (Vps26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008345

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791211.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791211.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791211.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791211.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791211.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34127962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:34128049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A16,A5,B104,B105,B119,B38,B39,B41,B52,B53,B6,B67,B81,B83,B87,B89,C20,C49,C9,D10,D5
`Chr2:34128080`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B54,C15
`Chr2:34128080`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B54,C15
`Chr2:34128096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B82,D2
`Chr2:34128096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,D2
`Chr2:34128112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:34128595`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A16,A18,A5,B105,B11,B111,B114,B123,B129,B133,B136,B21,B22,B26,B31,B55,B57,B58,B6,B74,B75,B82,B84,B87,B88,B93,C25,C26,C35,C4,C43,C45,C50,C51,C55,C67,C74,C76,C77,C79,C81,C9,D2,D4
`Chr2:34128600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B51,D11
`Chr2:34128876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:34128918`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B112,B80
`Chr2:34128918`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B112,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791211.1

139 aa

139

Vps26

PF03643 Vps26 79-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791211.1`	Pfam	`PF03643`	Vps26	Family	79	126	2.5e-17	63.5	Vacuolar protein sorting-associated protein 26

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935228.1
GGACTGCATAATCTTCATGGAAACTTTAATGTTCCAAACATGCCAGGTGCACTTGGATCGAGAAGTACAACTATGAATAACATTGCTTCAAGTGGGTTGCAACAAGCTTCTGGCAACCTTTCTACCGGACGTTTTGCATCCAACAACCTTCCAGTTGCTCTTTCTCAGGGATGGCAAGTAGGGGTGGTATGAATGTCATAGGAAACCAAGGGTATAGTAGCAGCACTAATGGAGTTGGTGGTTCTATCCCAGGGATCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008345
ATGGCAAGTAGGGGTGGTATGAATGTCATAGGAAACCAAGGGTATAGTAGCAGCACTAATGGAGTTGGTGGTTCTATCCCAGGGATCCTACCAACATCTGCTGCAATTGGCAATCGGACGTCTGTTCCCGGTCTTGGTGTGTCTCCGGTCTTAGGAAATGCAGGGCAATGGATTACAAGTTCAATGGGTAGTATAGTTGGTGGGGGCAACATTGGCCGAAATATTAGCTCAGGTGGAAGCATTACACACTTTCAAGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791211.1
MASRGGMNVIGNQGYSSSTNGVGGSIPGILPTSAAIGNRTSVPGLGVSPVLGNAGQWITSSMGSIVGGGNIGRNISSGGSITHFQDFVVWNYTPPPSINNSIKMEVGIEDCLHIEFEYNKGKYAMLTLMTQNLLPPMHS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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