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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001905`

染色体: Chr02 坐标: 34345531-34347496 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001905`
名称	SmilChr02G001905
描述	uncharacterized SmilChr02G001905
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34345531 - 34347496 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008351`
GeneID	`131008351`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008351`
原始查询	`LOC131008351`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.8; qcov=0.785; evalue=3.92e-43; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=36.8; qcov=0.769; evalue=1.49e-84; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008351

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791218.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791218.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791218.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791218.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791218.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34345531`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B105,B107,B120,B68,B91,C13,C33
`Chr2:34345536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B72,C32,C68,D7
`Chr2:34345549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C4
`Chr2:34345587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr2:34345612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C4,D10
`Chr2:34345629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:34345657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:34345665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr2:34345665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:34345685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C34
`Chr2:34345691`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B140,B56,B96
`Chr2:34345691`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B140,B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791218.1

562 aa

281

562

MULE

SWIM

PF10551 MULE 60-156 aa PF04434 SWIM 308-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791218.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	60	156	3.7e-13	50.4	MULE transposase domain
`XP_057791218.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	308	342	1.5e-10	41.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935235.1
ATGGTGAGAGGTTCCATAGAGCAACATTATGGTTCTTTGAGAAATTATATTGCGGAATTGAGAAGGGTTGATGGTGAGGGGCACTATGAGCTTATTCTTGAAGCAGATACTGTATTCAAAGCACTATATATGGGTTTGAGTGCCTTGAGAAAAGGATTCAAGAAGAGTTGCCGGCCTGTCATAGGCATAGATGGATGTTTTTTGAAAACATACCTCGGCGGTCATCTCCTTTGTGCAACAGGCAAGGATGGAAACAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008351
ATGGTGAGAGGTTCCATAGAGCAACATTATGGTTCTTTGAGAAATTATATTGCGGAATTGAGAAGGGTTGATGGTGAGGGGCACTATGAGCTTATTCTTGAAGCAGATACTGTATTCAAAGCACTATATATGGGTTTGAGTGCCTTGAGAAAAGGATTCAAGAAGAGTTGCCGGCCTGTCATAGGCATAGATGGATGTTTTTTGAAAACATACCTCGGCGGTCATCTCCTTTGTGCAACAGGCAAGGATGGAAACAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791218.1
MVRGSIEQHYGSLRNYIAELRRVDGEGHYELILEADTVFKALYMGLSALRKGFKKSCRPVIGIDGCFLKTYLGGHLLCATGKDGNNGMFPIAWAVVEAKNEGCWTWFLKCLLEDLDIGDGSGWTFISDQQKGSANVVAALAPKAEHWNCARHVYMNWKKEHKGQTLKNMFFRAVYATHEAEFKVAVLELKQESAAAHEDFMSRDINKFCKAFISSQPKSDSVDNNISECFNGYILNARGKHVIHMLEEIRSSLMVRQVQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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