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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001912`

染色体: Chr02 坐标: 34419529-34421310 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001912`
名称	SmilChr02G001912
描述	uncharacterized SmilChr02G001912
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34419529 - 34421310 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008354`
GeneID	`131008354`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008354`
原始查询	`LOC131008354`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G29750` (AT3G29750) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822661] identity=26.1; qcov=0.187; evalue=1.18e-07; confidence=weak
Rice	`Os04g0191000` - identity=24.4; qcov=0.877; evalue=2.61e-35; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02160 (Peptidase_A3); PF03732 (PEG10_N-capsid); PF08284 (RVP_2); PF30863 (PRO_PEG10-RTL1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008354

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791220.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791220.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791220.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791220.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791220.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34419529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:34419551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:34419683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C27
`Chr2:34419684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B70,B9
`Chr2:34419728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:34419748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:34419769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr2:34419844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B15,B70,B9,C79
`Chr2:34419869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr2:34419908`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A15,A6,B102,B103,B108,B126,B132,B134,B137,B15,B19,B28,B34,B41,B44,B50,B53,B54,B56,B59,B65,B69,B90,B95,B99,C13,C16,C17,C19,C26,C37,C46,C48,C49,C52,C63,C66,C73,C79,C86,C87,D10
`Chr2:34419910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B134,B95,C26,C46
`Chr2:34419912`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B128

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791220.1

593 aa

296

593

PEG10_N-capsid

RVP_2

Peptidase_A3

PRO_PEG10-RTL1

PF03732 PEG10_N-capsid 81-152 aa PF08284 RVP_2 385-469 aa PF02160 Peptidase_A3 386-467 aa PF30863 PRO_PEG10-RTL1 389-484 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791220.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	81	152	1.9e-10	41.6	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057791220.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	385	469	7e-12	46.0	Retroviral aspartyl protease
`XP_057791220.1`	Pfam	`PF02160`	Peptidase_A3	Family	386	467	7.4e-06	26.3	Cauliflower mosaic virus peptidase (A3)
`XP_057791220.1`	Pfam	`PF30863`	PRO_PEG10-RTL1	Domain	389	484	1e-09	39.5	PEG10/RTL1 protease domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935237.1
ATGGTTACTACGCGAAGTGCCGAATCTCGTTTGGAGGATGTAGAGAAGGCGATTGGGGAATTGTCTGTCGTCGTTCGGGAGTTGCAGACTTTCCAAGCGTCAACAGAAGCCCGCCACTCATCTATGGAGACCAAACTTGATGCCTTGATGAAGAAGTTTTCCATCTCTGTTGATACTCCACACGACGAGGAATCTGGCGGGAGTCACCACAACGAGGAGGAGACTTTACCACCCATGCACAAGATGGACCTTCCAGGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008354
ATGGTTACTACGCGAAGTGCCGAATCTCGTTTGGAGGATGTAGAGAAGGCGATTGGGGAATTGTCTGTCGTCGTTCGGGAGTTGCAGACTTTCCAAGCGTCAACAGAAGCCCGCCACTCATCTATGGAGACCAAACTTGATGCCTTGATGAAGAAGTTTTCCATCTCTGTTGATACTCCACACGACGAGGAATCTGGCGGGAGTCACCACAACGAGGAGGAGACTTTACCACCCATGCACAAGATGGACCTTCCAGGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791220.1
MVTTRSAESRLEDVEKAIGELSVVVRELQTFQASTEARHSSMETKLDALMKKFSISVDTPHDEESGGSHHNEEETLPPMHKMDLPGFDGSDAHSWLARAEQYFLVHATPTDQRVKIALIAMSSSAMPWIQMLLRRCPSLTWSRFTRELLIRFGDGSAINGFEALATTNQTGTLDEYISAFETRVSQLPEFSNEQYLGFFLGGLKKELRMMIQDLTITDYSAAIQMARKLDSVCTPQTSSPSFRVTTTPTPPSRSSFQPRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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