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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001914`

染色体: Chr02 坐标: 34443481-34445251 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001914`
名称	SmilChr02G001914
描述	CASP-like protein 5C1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	34443481 - 34445251 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008355`
GeneID	`131008355`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008355`
原始查询	`LOC131008355`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 5C1
产物	CASP-like protein 5C1
Arabidopsis	`AT3G50810` (AT3G50810) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824245] identity=42.1; qcov=0.731; evalue=3.31e-29; confidence=medium
Rice	`Os03g0767900` - identity=44.2; qcov=0.659; evalue=2.85e-20; confidence=low
GO	GO:0003684 (damaged DNA binding); GO:0006281 (DNA repair); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom); PF11799 (IMS_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008355

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057791221.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057791221.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791221.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057791221.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791221.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:34443558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A1,A19,A3,B109,B122,B123,B132,B137,B19,B3,B44,B5,B61,B69,B73,C41,C55,C67,C77,C82
`Chr2:34443691`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B98
`Chr2:34443691`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B98
`Chr2:34443716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C74,D7
`Chr2:34443730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B72
`Chr2:34444845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A1,A19,A3,B109,B122,B132,B137,B19,B3,B44,B5,B6,B61,B69,B73,C41,C55,C67,C77,C82
`Chr2:34444864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:34445087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791221.1

182 aa

182

CASP_dom

IMS_C

PF04535 CASP_dom 30-120 aa PF11799 IMS_C 123-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791221.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	30	120	2e-12	47.8	Casparian strip membrane protein domain
`XP_057791221.1`	Pfam	`PF11799`	IMS_C	Domain	123	172	1.5e-07	32.6	impB/mucB/samB family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935238.1
ATGAAAAGTGTACCGGGATCTTTAGGAACAACTGCTAGCATTGCTTTGAGGTTTGGGCAGGTCATATTCTCTTCATCGTCTATAGTCTTCATGTCTTAGATGTCTTTAGGAGTTGCTATTCCATGGAGTTTCACTTTGGCGATACTCGATGGATATTCCATCCTGGCTAAGTTTCCCGTACATCAATCTGGCATTTTCATGGTTATCATAACAGGGGACTTGGTATTACCCTTTCTCACACTAGCAGCAGCAAGCTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008355
ATGAAAAGTGTACCGGGATCTTTAGGAACAACTGCTAGCATTGCTTTGAGGTTTGGGCAGGTCATATTCTCTTCATCGTCTATAGTCTTCATGTCTTAGATGTCTTTAGGAGTTGCTATTCCATGGAGTTTCACTTTGGCGATACTCGATGGATATTCCATCCTGGCTAAGTTTCCCGTACATCAATCTGGCATTTTCATGGTTATCATAACAGGGGACTTGGTATTACCCTTTCTCACACTAGCAGCAGCAAGCTCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791221.1
MKSVPGSLGTTASIALRFGQVIFSSSSIVFMSLXMSLGVAIPWSFTLAILDGYSILAKFPVHQSGIFMVIITGDLVLPFLTLAAASSTASLVEILLKTDVSFCPSRLCSRYQISAAMAFIRESKSIGAEVNWGVRFNNANDAQHFLKNLYKEVALRLQGCGVQGRAFTLKVVSKTLYDRFLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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