当前解析结果
SmilChr02G001954| 统一新 Gene ID | SmilChr02G001954 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G001954 |
| 描述 | probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 35252986 - 35253949 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008371 |
|---|---|
| GeneID | 131008371 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008371 |
| 原始查询 | LOC131008371 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470 |
| 产物 | probable sugar phosphate/phosphate translocator At1g06470 |
| Arabidopsis | AT1G06470 (AT1G06470)Nucleotide/sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837159] identity=69.4; qcov=0.904; evalue=6.75e-36; confidence=medium |
| Rice | Os06g0153200- identity=70.6; qcov=0.904; evalue=5.02e-37; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008371 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057791238.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.60000 | XP_057791238.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057791238.1 |
| 4 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057791238.1 |
| 5 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057791238.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:35253469 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B103,B53,C61 |
Chr2:35253469 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B103,B53,C61 |
Chr2:35253475 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
Chr2:35253564 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B16,C67 |
Chr2:35253566 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B68,C18,C85 |
Chr2:35253578 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B124,B129,C7,D5 |
Chr2:35253595 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C51,C8 |
Chr2:35253627 |
AAG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 25 | A14,A5,A9,B105,B109,B110,B13,B137,B18,B20,B39,B41,B44,B56,B64,B76,C1,C22,C44,C56,C58,C63,C65,C66,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。