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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001968`

染色体: Chr02 坐标: 35612559-35613464 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001968`
名称	SmilChr02G001968
描述	uncharacterized SmilChr02G001968
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	35612559 - 35613464 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008376`
GeneID	`131008376`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008376`
原始查询	`LOC131008376`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=44.7; qcov=0.685; evalue=9.09e-49; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=39.9; qcov=1.2; evalue=8.93e-69; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008376

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791243.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057791243.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057791243.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791243.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791243.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:35612564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr2:35612596`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B35,B40,C36
`Chr2:35612596`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B35,B40,C36
`Chr2:35612883`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B110,B130,B54,B9,C33
`Chr2:35612883`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B110,B130,B54,B9,C33
`Chr2:35612895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B133,B45,C13
`Chr2:35612920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C37
`Chr2:35612922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	82	A10,A11,A13,A15,A18,A20,A23,A3,A5,A6,A7,B100,B101,B107,B110,B113,B120,B128,B14,B15,B16,B19,B25,B27,B28,B33,B38,B39,B43,B44,B45,B48,B52,B55,B6,B60,B61,B62,B66,B67,B71,B72,B76,B77,B79,B80,B81,B85,B90,B93,B97,B99,C1,C10,C11,C18,C24,C25,C26,C29,C3,C31,C37,C4,C43,C44,C52,C54,C57,C62,C65,C67,C69,C73,C79,C8,C80,C83,C9,D2,D3,D8
`Chr2:35612952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr2:35612953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B84,C11,C17,D9
`Chr2:35612969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr2:35612974`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791243.1

248 aa

124

248

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF13359 DDE_Tnp_4 43-163 aa PF04827 Plant_tran 47-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791243.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	43	163	1.9e-06	28.3	DDE superfamily endonuclease
`XP_057791243.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	47	173	5.3e-63	213.0	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935260.1
ATGAGCGCACAAACTATAAGAAAATCAGTTGAAAAATTCGTGCAAGGTGTAGTTCACAACTTCAGTGGGGAGTACCTCAGAAGGCCAACCGAAGAAGATCTTGCTTATCTATTGTATGTTGGTGCTCAACGCGGTTTTCCTGGTTCGAGAAATGATATCAACGTGCTTCACCAATTGCCTGTTTTCTCAGATATATTGGAAGGTCGAGCACCAAAGGTTAGTTATGTGATAAATGGCCATGAAAAAGATATGGGATATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008376
ATGAGCGCACAAACTATAAGAAAATCAGTTGAAAAATTCGTGCAAGGTGTAGTTCACAACTTCAGTGGGGAGTACCTCAGAAGGCCAACCGAAGAAGATCTTGCTTATCTATTGTATGTTGGTGCTCAACGCGGTTTTCCTGGTTCGAGAAATGATATCAACGTGCTTCACCAATTGCCTGTTTTCTCAGATATATTGGAAGGTCGAGCACCAAAGGTTAGTTATGTGATAAATGGCCATGAAAAAGATATGGGATATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791243.1
MSAQTIRKSVEKFVQGVVHNFSGEYLRRPTEEDLAYLLYVGAQRGFPGSRNDINVLHQLPVFSDILEGRAPKVSYVINGHEKDMGYYLTDGIYPSWAAFVKSVNGPQTRKHQLFAQHQEAARKDVERAFGILQARFNFIKRPCLMWDRDMMRKVMLACIIMHNMIVEDERHTYLNYCDPTKFMEVRRFNSQSGDVEANDDPNFEFSTERIASLESYMRNRTQLRNREAHNALKNDLIEHIWQKFGDDN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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