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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002021`

染色体: Chr02 坐标: 36437830-36440922 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002021`
名称	SmilChr02G002021
描述	uncharacterized SmilChr02G002021
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	36437830 - 36440922 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008384`
GeneID	`131008384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008384`
原始查询	`LOC131008384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=28.7; qcov=0.433; evalue=2.92e-41; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=30.4; qcov=0.658; evalue=2.15e-89; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791251.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791251.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791251.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791251.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791251.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:36438120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C60,D9
`Chr2:36438122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr2:36438144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:36438170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:36438300`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr2:36438300`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B105
`Chr2:36438311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D6
`Chr2:36438379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	51	A14,A20,A23,A8,B109,B11,B114,B133,B139,B20,B22,B31,B39,B42,B43,B47,B5,B51,B69,B79,B85,B9,B92,B95,C12,C13,C17,C2,C27,C28,C3,C31,C33,C37,C4,C43,C45,C49,C51,C55,C56,C59,C64,C73,C74,C77,C78,C84,C85,D7,D9
`Chr2:36438381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B51,B73
`Chr2:36438428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr2:36438444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:36438458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791251.1

1030 aa

515

1030

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 257-517 aa PF13966 zf-RVT 773-852 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791251.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	257	517	3.1e-31	109.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057791251.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	773	852	1.1e-13	52.4	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935268.1
ATGTGGACCTTGCACCCGGACTTCTTGGATTTGGTTAAAGTCTCCTGGTCGAACACGGTAGATAACTCTTGCCCCATCTATACGGTTATGATCAAGCTTAAGAGATTAAGAACAGAAATCCGTAACTGGAATAAAAGCACGTTTGGCAATGTGGATTCGATGATTATGGAAAAACAGCAAGATCTGTCTGAGATTCATGAGAAAATCGCTATTGAGGGCTACACTGAAGAACTGTTTGATAAAGAGATTGTGGCGCAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008384
ATGTGGACCTTGCACCCGGACTTCTTGGATTTGGTTAAAGTCTCCTGGTCGAACACGGTAGATAACTCTTGCCCCATCTATACGGTTATGATCAAGCTTAAGAGATTAAGAACAGAAATCCGTAACTGGAATAAAAGCACGTTTGGCAATGTGGATTCGATGATTATGGAAAAACAGCAAGATCTGTCTGAGATTCATGAGAAAATCGCTATTGAGGGCTACACTGAAGAACTGTTTGATAAAGAGATTGTGGCGCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791251.1
MWTLHPDFLDLVKVSWSNTVDNSCPIYTVMIKLKRLRTEIRNWNKSTFGNVDSMIMEKQQDLSEIHEKIAIEGYTEELFDKEIVAQASINDTLSRKNSLLQQKSRAAWLQDGDRNSNFFHNMLRYKKKPHFIPHLTIDGNTYVDQNRIGNHIVDFFTNLFTEISHVQANIVDVEAILDQVISDQQNDMLSAIPNEEEITAAVFQMDSNSSPGPDGFSGKFFHHCWDIIKKDICRAVITFFSKSYLPLGCNANTLILIPKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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