当前解析结果
SmilChr02G002028| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002028 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002028 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002028 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 36517456 - 36518394 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008388 |
|---|---|
| GeneID | 131008388 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008388 |
| 原始查询 | LOC131008388 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0303800; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os11g0303800; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT5G41220 (GSTT3)glutathione S-transferase THETA 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834124] identity=24.3; qcov=0.502; evalue=9.05e-10; confidence=weak |
| Rice | Os11g0303800- identity=24.6; qcov=0.966; evalue=1.02e-18; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008388 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791255.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791255.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791255.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791255.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057791255.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:36517464 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,D1,D10 |
Chr2:36517532 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B84,C77 |
Chr2:36517538 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B95,C14,C48 |
Chr2:36517590 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B81,C33,C79 |
Chr2:36517604 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,B65,B98,C1,C59 |
Chr2:36517639 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B115,B23,B34,B80,C22,C27,C44,C45,C61,C71,C82 |
Chr2:36517644 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B115,B23,B34,B80,C22,C27,C44,C45,C61,C71,C82 |
Chr2:36517724 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B129,B137,C16,C37,C49 |
Chr2:36517725 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B137,C16,C49 |
Chr2:36517750 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,C22 |
Chr2:36517751 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B132,B5,B71,C62 |
Chr2:36517761 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。