Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002034`

染色体: Chr02 坐标: 36626661-36627458 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002034`
名称	SmilChr02G002034
描述	FK506-binding protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	36626661 - 36627458 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008392`
GeneID	`131008392`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008392`
原始查询	`LOC131008392`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FK506-binding protein 4-like
产物	FK506-binding protein 4-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008392

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791259.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057791259.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057791259.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057791259.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:36626690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B31,C64,C66
`Chr2:36626695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C82
`Chr2:36626703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B42,B43,B49,C56,C65,D9
`Chr2:36626717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:36626758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:36626762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C37
`Chr2:36626765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:36626772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:36626784`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B111,C46
`Chr2:36626784`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B111,C46
`Chr2:36626787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr2:36626842`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A21,B107,B117,B129,B138,B139,B17,B20,B24,B32,B42,B43,B53,B71,B76,B85,B90,B91,B92,B93,C12,C18,C50,C55,C57,C58,C7,C72,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935276.1
ATGGTCTCCACCAGACCCAAAAACAAACTCCGAGGCATACCCCAAGGAACAGAAATCGATCTCACCGAAGAAAGCCCTTCACCGTCAAAACCCAAAACTTCGAAGAAAACCCCACGAAAAAAACCACTTTCGATGGAAACTACACCTACCCCCTCATCCAAAACCCTACCACAACCCGAGAGCCCTTCGCCGGTGGACGAACATGCCATTGAGCAACTCACGGCGGAGATAGACGTACCTACTCTCGGCGCCGGTGACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008392
ATGGTCTCCACCAGACCCAAAAACAAACTCCGAGGCATACCCCAAGGAACAGAAATCGATCTCACCGAAGAAAGCCCTTCACCGTCAAAACCCAAAACTTCGAAGAAAACCCCACGAAAAAAACCACTTTCGATGGAAACTACACCTACCCCCTCATCCAAAACCCTACCACAACCCGAGAGCCCTTCGCCGGTGGACGAACATGCCATTGAGCAACTCACGGCGGAGATAGACGTACCTACTCTCGGCGCCGGTGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791259.1
MVSTRPKNKLRGIPQGTEIDLTEESPSPSKPKTSKKTPRKKPLSMETTPTPSSKTLPQPESPSPVDEHAIEQLTAEIDVPTLGAGDQHAAEEEGKATPEKAKEGEEEPSKKKRTPTIPKRKKPAAEKSATPAEGSSNERNKPSGSVLQSEQGESGEEQEETPAKRRRKVMNPTPIRMIKGEPASASRSKKKGIAVLKIPDMDALKPLGIVEKVKEYFNNIGWKKIFGLARARIRGGGERSVRVYASRYQPNLRTSGHEFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器