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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002094`

染色体: Chr02 坐标: 37594703-37595305 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002094`
名称	SmilChr02G002094
描述	uncharacterized SmilChr02G002094
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	37594703 - 37595305 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008408`
GeneID	`131008408`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008408`
原始查询	`LOC131008408`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876]; symbol=AT2G42760; hit=AT2G42760; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876]; symbol=AT2G42760; hit=AT2G42760; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G42760` (AT2G42760) DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876] identity=39.3; qcov=0.89; evalue=2.59e-28; confidence=medium
Rice	`Os06g0550800` - identity=36.2; qcov=0.705; evalue=2.82e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07939 (DUF1685)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008408

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791273.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791273.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791273.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057791273.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791273.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:37594748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,C56,C65,D9
`Chr2:37594797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B47,B78,C82
`Chr2:37594848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B131,C8
`Chr2:37594850`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B15,B56,B64,B96
`Chr2:37594850`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B15,B56,B64,B96
`Chr2:37594933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:37594967`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A8,B25,B38,B39,B97,C13,C59,C84
`Chr2:37594968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:37595044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791273.1

200 aa

100

200

DUF1685

PF07939 DUF1685 101-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791273.1`	Pfam	`PF07939`	DUF1685	Family	101	131	1.4e-05	25.5	Protein of unknown function (DUF1685)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935290.1
ATGGAAGCTGAACAAATTCTTGCGCTCATGGATTCTTGGTGGTTTGAACGTCGAATAATATTTCGAAATAAAGATGAATTCCCGTCTCCTGCAGCCGAATCGACGCACCAGAAAACGGCTTCTCGACGGCAGCATCTTGGAATCCGATCATACAGCGATCGTTGTTGCATAGGTGTCGGTTTCGAAGCAGATTCTCCGACATCAGTGATCATCAAACCAAAGCTGCAGAAGATTCCCTCAGGGAGAGAGATTAAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008408
ATGGAAGCTGAACAAATTCTTGCGCTCATGGATTCTTGGTGGTTTGAACGTCGAATAATATTTCGAAATAAAGATGAATTCCCGTCTCCTGCAGCCGAATCGACGCACCAGAAAACGGCTTCTCGACGGCAGCATCTTGGAATCCGATCATACAGCGATCGTTGTTGCATAGGTGTCGGTTTCGAAGCAGATTCTCCGACATCAGTGATCATCAAACCAAAGCTGCAGAAGATTCCCTCAGGGAGAGAGATTAAGAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791273.1
MEAEQILALMDSWWFERRIIFRNKDEFPSPAAESTHQKTASRRQHLGIRSYSDRCCIGVGFEADSPTSVIIKPKLQKIPSGREIKRERGMNISRSLSALEFEELKGFMDLGFVFNEEEEKNWELVSIVPGLQKWRRADQVEKKARVSRPYLSEAWGDMCRRGGDAKNFMNWKIPIPSLKNDIHMKDHLKNWAHVVASTVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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