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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002168`

染色体: Chr02 坐标: 38908867-38910207 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002168`
名称	SmilChr02G002168
描述	UDP-glucuronate 4-epimerase 6-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	38908867 - 38910207 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008420`
GeneID	`131008420`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008420`
原始查询	`LOC131008420`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-glucuronate 4-epimerase 6-like
产物	UDP-glucuronate 4-epimerase 6-like
Arabidopsis	`AT3G23820` (GAE6) UDP-D-glucuronate 4-epimerase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821965] identity=50.9; qcov=1.18; evalue=2.23e-42; confidence=medium
Rice	`Os02g0791500` (OsUGlcAE3) - identity=45.7; qcov=1.17; evalue=9.23e-34; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01370 (Epimerase); PF16363 (GDP_Man_Dehyd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008420

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057791285.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057791285.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057791285.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791285.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:38908882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:38908910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C48
`Chr2:38908916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C37,D4
`Chr2:38908925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B111,D8
`Chr2:38908925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D8
`Chr2:38908929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,D8
`Chr2:38908930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B54,C8
`Chr2:38908940`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A16,A7,B1,B103,B118,B122,B127,B13,B2,B41,B42,B43,B61,C30,C51,C56,C62,C65,D9
`Chr2:38908956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C84
`Chr2:38908968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B114,B115,B126
`Chr2:38908983`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	43	A20,B10,B11,B110,B111,B114,B125,B133,B134,B137,B16,B19,B28,B33,B35,B37,B57,B6,B69,B74,B75,B77,B79,B81,B85,B88,B9,C10,C15,C28,C36,C39,C46,C51,C67,C7,C70,C71,C77,C85,C86,D3,D9
`Chr2:38908989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791285.1

150 aa

150

GDP_Man_Dehyd

Epimerase

PF16363 GDP_Man_Dehyd 6-59 aa PF01370 Epimerase 6-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791285.1`	Pfam	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	Domain	6	59	7.3e-09	36.3	GDP-mannose 4,6 dehydratase
`XP_057791285.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	6	61	2.1e-10	41.1	NAD dependent epimerase/dehydratase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935302.1
ATGGACTCATCAGTCCCCTTCTCCCACATTCTCCACCTGGCTACGCAGGCCGGCGTCTGGTACGCCATCCAGAACCCCCTCTCCTACGTCAACTCCAACATCACCGGCTTCGTCACCCTCCTGGAGGTGGCCAAGGCCGCCGATCCCCAGCCCGCCATCGTGTGGGCCTCTACGTCAACTCCAACACATAGGTCCTTTTCTCCGAGTCCGACCGCACCTACCGCCCCACCAGCTTCTACGCGGCCACCAAGAAAGCCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008420
ATGGACTCATCAGTCCCCTTCTCCCACATTCTCCACCTGGCTACGCAGGCCGGCGTCTGGTACGCCATCCAGAACCCCCTCTCCTACGTCAACTCCAACATCACCGGCTTCGTCACCCTCCTGGAGGTGGCCAAGGCCGCCGATCCCCAGCCCGCCATCGTGTGGGCCTCTACGTCAACTCCAACACATAGGTCCTTTTCTCCGAGTCCGACCGCACCTACCGCCCCACCAGCTTCTACGCGGCCACCAAGAAAGCCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791285.1
MDSSVPFSHILHLATQAGVWYAIQNPLSYVNSNITGFVTLLEVAKAADPQPAIVWASTSTPTHRSFSPSPTAPTAPPASTRPPRKPARPSRTLGVGRLGIGGRGSKGINVYVTQEDKEVARDFTYIDDIVKGCVGALDMAEKSTCKAGKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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