当前解析结果
SmilChr02G002171| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002171 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002171 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002171 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 38920173 - 38920694 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008422 |
|---|---|
| GeneID | 131008422 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008422 |
| 原始查询 | LOC131008422 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008422 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057791286.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057791286.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057791286.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791286.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791286.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:38920177 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B43,C13,C14 |
Chr2:38920196 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,C61 |
Chr2:38920214 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,A25,B113,B28,C18 |
Chr2:38920227 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B102,B87,C25 |
Chr2:38920227 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B102,B87,C25 |
Chr2:38920244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B74,C41,C56 |
Chr2:38920248 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A5,B104,B114,B115,B126,B49,B70 |
Chr2:38920265 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B119,B120,B129,B3 |
Chr2:38920275 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A2 |
Chr2:38920275 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A2 |
Chr2:38920282 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | A13,B104,B108,B112,B95,C12,C14,C23,C53,C57 |
Chr2:38920299 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,C43,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。