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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002173`

染色体: Chr02 坐标: 38956013-38956561 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002173`
名称	SmilChr02G002173
描述	uncharacterized protein At5g19025-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	38956013 - 38956561 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008424`
GeneID	`131008424`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008424`
原始查询	`LOC131008424`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819792]; symbol=AT3G06180; hit=AT3G06180; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819792]; symbol=AT3G06180; hit=AT3G06180; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G06180` (AT3G06180) Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819792] identity=50; qcov=0.758; evalue=2.13e-26; confidence=medium
Rice	`Os05g0488500` - identity=62.5; qcov=0.176; evalue=3.55e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28125 (At5g19025_N); PF30682 (At5g19025_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008424

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057791288.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057791288.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057791288.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057791288.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:38956021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B7
`Chr2:38956041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B7
`Chr2:38956101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B45
`Chr2:38956103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,C27,C36,C76,C8
`Chr2:38956111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B7
`Chr2:38956116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B7
`Chr2:38956117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr2:38956126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	41	A18,A23,A4,A8,B105,B108,B109,B111,B139,B140,B18,B2,B20,B22,B3,B30,B36,B45,B49,B62,B64,B71,B73,B78,B84,B94,B98,C10,C19,C31,C35,C43,C44,C45,C5,C59,C60,C61,C72,C87,D8
`Chr2:38956142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr2:38956153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B14
`Chr2:38956185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B5,B53,B85
`Chr2:38956208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791288.1

182 aa

182

At5g19025_N

At5g19025_C

PF28125 At5g19025_N 47-127 aa PF30682 At5g19025_C 142-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791288.1`	Pfam	`PF28125`	At5g19025_N	Domain	47	127	1.3e-17	65.1	At5g19025 N-terminal domain
`XP_057791288.1`	Pfam	`PF30682`	At5g19025_C	Domain	142	174	1.1e-07	32.2	At5g19025 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935305.1
ATGCGCCATCTCCACCACTCCATCACCGCCATGGCCCTTTCCTCCTCCCTCAGAAAAACCCCAATTCCAAAAACCCCCGCCCCCAACCACCCGAATTCCCCAAACTGCCCCTCCCTCTGCCGCCACTCGCCCTCCGCCACTCTCGACCTCCTCATCTTCATCCTCGTCCTCTTCTCTGGCGCCTTCCTCATTGTCTCCTGCTTCTCCTATCTCTTCCAGTCGCTCTCTCTCATCCTGCCCCCTTTCTCCACCGTGGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008424
ATGCGCCATCTCCACCACTCCATCACCGCCATGGCCCTTTCCTCCTCCCTCAGAAAAACCCCAATTCCAAAAACCCCCGCCCCCAACCACCCGAATTCCCCAAACTGCCCCTCCCTCTGCCGCCACTCGCCCTCCGCCACTCTCGACCTCCTCATCTTCATCCTCGTCCTCTTCTCTGGCGCCTTCCTCATTGTCTCCTGCTTCTCCTATCTCTTCCAGTCGCTCTCTCTCATCCTGCCCCCTTTCTCCACCGTGGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791288.1
MRHLHHSITAMALSSSLRKTPIPKTPAPNHPNSPNCPSLCRHSPSATLDLLIFILVLFSGAFLIVSCFSYLFQSLSLILPPFSTVAAHFHCHFASNPQSQLIFFTLFAISFVGFVIFFEICCGHRSRRCERKGCRGLKKAMEFDLQLQGEELLRSGDGNKAVRDVNELPWKGGGGLHGVSVV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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