当前解析结果
SmilChr02G002194| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002194 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002194 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002194 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 39158517 - 39159026 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008426 |
|---|---|
| GeneID | 131008426 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008426 |
| 原始查询 | LOC131008426 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008426 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791290.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057791290.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791290.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791290.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791290.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:39158533 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr2:39158553 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,C1 |
Chr2:39158557 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B115,B128,B20,B73,B98,C36,C57 |
Chr2:39158576 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 131 | A11,A2,A21,A23,A25,A7,A8,A9,B10,B100,B103,B105,B106,B108,B11,B110,B114,B115,B117,B119,B122,B127,B128,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B16,B17,B18,B2,B20,B24,B25,B28,B29,B34,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B46,B47,B50,B52,B53,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B65,B66,B68,B69,B71,B72,B73,B75,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B89,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C18,C19,C2,C21,C23,C25,C29,C32,C33,C35,C36,C38,C4,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C54,C56,C57,C60,C62,C64,C67,C68,C69,C70,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C80,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D9 |
Chr2:39158685 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C35 |
Chr2:39158685 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr2:39158687 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B115,B20,B73,C36,C57 |
Chr2:39158715 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr2:39158728 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B20,C36 |
Chr2:39158748 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr2:39158753 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 29 | A14,A3,B132,B135,B140,B16,B17,B3,B32,B37,B40,B6,B68,B90,B92,B93,C12,C15,C20,C28,C34,C41,C43,C56,C63,C70,C81,D11,D6 |
Chr2:39158756 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B72,B82,C73 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。