当前解析结果
SmilChr02G002195| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002195 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002195 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002195 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 39161798 - 39162751 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008427 |
|---|---|
| GeneID | 131008427 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008427 |
| 原始查询 | LOC131008427 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008427 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057791291.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057791291.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057791291.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791291.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791291.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:39161801 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B26,C69 |
Chr2:39161805 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B14,C38,C53,C66,C82 |
Chr2:39161808 |
T |
TTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 32 | A20,A4,B10,B102,B105,B109,B12,B125,B18,B4,B41,B45,B48,B5,B55,B72,B77,B81,B98,B99,C11,C22,C27,C41,C55,C60,C61,C64,C76,C8,C86,D1 |
Chr2:39161833 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C84 |
Chr2:39161836 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B61 |
Chr2:39161837 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C84 |
Chr2:39161840 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B30,B55 |
Chr2:39161850 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B134,B22,B96,D10 |
Chr2:39161860 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,C68,C79 |
Chr2:39161875 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A13,A3,B106,B31,C17,C20 |
Chr2:39161885 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C67 |
Chr2:39161908 |
CTA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 27 | A18,A21,A24,A9,B1,B107,B120,B135,B20,B22,B28,B3,B33,B37,B41,B62,B75,B83,B94,C19,C25,C42,C5,C62,C77,C79,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。