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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002199`

染色体: Chr02 坐标: 39226588-39227571 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002199`
名称	SmilChr02G002199
描述	uncharacterized SmilChr02G002199
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39226588 - 39227571 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008431`
GeneID	`131008431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008431`
原始查询	`LOC131008431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=56.1; qcov=0.652; evalue=3.01e-37; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=46.5; qcov=0.957; evalue=1.22e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791295.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057791295.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791295.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791295.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791295.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39226591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B71
`Chr2:39226597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B55,B94,C11,C51
`Chr2:39226600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr2:39226634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B9,C69,C71
`Chr2:39226671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	76	A15,A2,A22,A25,A3,A4,A5,B10,B101,B104,B106,B107,B119,B121,B122,B125,B127,B131,B133,B135,B136,B137,B140,B16,B23,B24,B27,B28,B29,B32,B33,B38,B40,B41,B49,B5,B54,B55,B57,B69,B74,B8,B86,B90,B94,C1,C11,C12,C17,C24,C25,C28,C3,C30,C34,C35,C37,C38,C43,C46,C47,C48,C5,C51,C56,C61,C63,C69,C7,C75,C78,C8,C84,C87,D11,D3
`Chr2:39226689`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr2:39226689`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr2:39226694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:39226744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B5,B74,C28
`Chr2:39226759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C71
`Chr2:39226770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B61,B72
`Chr2:39226786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B87,C12,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791295.1

164 aa

164

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 4-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791295.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	4	103	1.7e-41	142.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935312.1
ATGGGAGTGCCGGTCACATATCAAGTCAACAACGCCTACTACACAAGTGGGTACTACTTGACTGACGGCATCTATCCCAATTGGCCTGTATTCGTGAAGAGTCCTACACATCCGACGGATCCGAAGGGGAAGAGGTTCAAAGTGATGCAGGAAGCGGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCCTTCGGCGTCCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCGTCAAAGGCCCAGCGCGTCTTTGGAGCAAGGAGGCGATGAGCGACATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008431
ATGGGAGTGCCGGTCACATATCAAGTCAACAACGCCTACTACACAAGTGGGTACTACTTGACTGACGGCATCTATCCCAATTGGCCTGTATTCGTGAAGAGTCCTACACATCCGACGGATCCGAAGGGGAAGAGGTTCAAAGTGATGCAGGAAGCGGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCCTTCGGCGTCCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCGTCAAAGGCCCAGCGCGTCTTTGGAGCAAGGAGGCGATGAGCGACATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791295.1
MGVPVTYQVNNAYYTSGYYLTDGIYPNWPVFVKSPTHPTDPKGKRFKVMQEAARKDIERAFGVLQARWAIVKGPARLWSKEAMSDIMFTCIILHNMIIEDEGEEATQWEEDADEASSSAAFQPRTGALPDFRAFVARQASMRDAEMHACLTLDLKEHIWSHTTV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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