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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002236`

染色体: Chr02 坐标: 39697080-39698597 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002236`
名称	SmilChr02G002236
描述	uncharacterized SmilChr02G002236
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39697080 - 39698597 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008437`
GeneID	`131008437`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008437`
原始查询	`LOC131008437`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=34.3; qcov=0.429; evalue=9.1e-22; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008437

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791301.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057791301.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057791301.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791301.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791301.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39697083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr2:39697087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C33
`Chr2:39697176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B13,B135,B34,B52,B60,B82,B83,B85,C10,C15,C30,C42,C52,C84
`Chr2:39697185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C16,C60
`Chr2:39697186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A3,B20
`Chr2:39697197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B59,B74,B95,C72
`Chr2:39697205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr2:39697207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr2:39697222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B74,B95,C72
`Chr2:39697229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	45	A16,A22,A4,B1,B103,B120,B125,B14,B18,B2,B30,B37,B41,B42,B43,B6,B60,B63,B72,B77,B8,B80,B83,B85,B90,B91,B92,B95,B97,C12,C13,C14,C18,C21,C52,C54,C63,C70,C73,C77,C79,C84,D10,D11,D6
`Chr2:39697231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B74,B95,C72
`Chr2:39697244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B32,B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791301.1

394 aa

197

394

DUF7769

PF24964 DUF7769 6-60 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791301.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	6	60	2.9e-12	46.8	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935318.1
ATGCGGCGCAAAGATCTAACAACGGGAGAGAGAAACTCCATAGTGCAGATTCTGCTTGAAGACAGCCATGGTGGGAAGCCAAAAAGGGGCAGAATGCAGGTTGTCGCCGTCAAGTTTGCCGTTTGCCGTCGAACGGTGACTCGGTTATGGACTGCTGCAAAAAACCAACAAGCACAAGGTCAGCATATTCATAGTAGCAGAGGCAAAATCAACAAACCAAGGCACAAGAGAGTTGAAATAGATCTTCAATTAATTTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008437
ATGCGGCGCAAAGATCTAACAACGGGAGAGAGAAACTCCATAGTGCAGATTCTGCTTGAAGACAGCCATGGTGGGAAGCCAAAAAGGGGCAGAATGCAGGTTGTCGCCGTCAAGTTTGCCGTTTGCCGTCGAACGGTGACTCGGTTATGGACTGCTGCAAAAAACCAACAAGCACAAGGTCAGCATATTCATAGTAGCAGAGGCAAAATCAACAAACCAAGGCACAAGAGAGTTGAAATAGATCTTCAATTAATTTCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791301.1
MRRKDLTTGERNSIVQILLEDSHGGKPKRGRMQVVAVKFAVCRRTVTRLWTAAKNQQAQGQHIHSSRGKINKPRHKRVEIDLQLISTLELSKRSTIRRLASGISCSKSTVGRWISKGLIRAHTSAIKPDLTAPNKLLRLRFSLEAIEYDRILKVLQFKSMHNTMHIEEKWFYITKSNHRPLIAEDGTILFDGKIGIFPFTEYIPAKRNSKNREIIPAIKAKWPQFASRVIFIQQDNAKPHIKDSDPDFRQAASSDGFDIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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