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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002244`

染色体: Chr02 坐标: 39856971-39857840 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002244`
名称	SmilChr02G002244
描述	uncharacterized SmilChr02G002244
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39856971 - 39857840 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008441`
GeneID	`131008441`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008441`
原始查询	`LOC131008441`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922]; symbol=AT3G47680; hit=AT3G47680; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=26.1; qcov=0.875; evalue=3.39e-14; confidence=low
Rice	`Os12g0228500` - identity=24.5; qcov=0.931; evalue=5.49e-13; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008441

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791303.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791303.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791303.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791303.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791303.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39856985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B2,B30,B7,B81
`Chr2:39857002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C55
`Chr2:39857040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B122,C16,C60
`Chr2:39857059`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A5
`Chr2:39857059`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A5
`Chr2:39857082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:39857135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr2:39857141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:39857173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:39857180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B30,B7,B81
`Chr2:39857183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr2:39857257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791303.1

289 aa

144

289

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 134-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791303.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	134	260	2.3e-06	29.3	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935320.1
ATGGGTGTTCAACAACGCCCAAACAAAAATCATAAAGGGGCAAAAAATGTAGCTTGGTGTGTGAAGGAAGATGTTGCCCTTATGTCATCTTGGATCTATGCTAGCGAAGATAACATTCGAGGAAAAAATCAAAGAGGGGAATCGCTTTGGGCACGTGTTCATAAATTGTATCACAACACCCAAGCAGAAAATCCAAATGAGCTCAACGAACGAAACATTGAATCGATGAAAGGTCACTGGAAACGTCTTAACGAAAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008441
ATGGGTGTTCAACAACGCCCAAACAAAAATCATAAAGGGGCAAAAAATGTAGCTTGGTGTGTGAAGGAAGATGTTGCCCTTATGTCATCTTGGATCTATGCTAGCGAAGATAACATTCGAGGAAAAAATCAAAGAGGGGAATCGCTTTGGGCACGTGTTCATAAATTGTATCACAACACCCAAGCAGAAAATCCAAATGAGCTCAACGAACGAAACATTGAATCGATGAAAGGTCACTGGAAACGTCTTAACGAAAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791303.1
MGVQQRPNKNHKGAKNVAWCVKEDVALMSSWIYASEDNIRGKNQRGESLWARVHKLYHNTQAENPNELNERNIESMKGHWKRLNENGNKWVAACRETNARRRSGMSDNDVEKEAHSIYAAGGNRFLDLVVFNEVVSKHPKWNVHDTTHVFRRQSEDADDQESGGSSKRSKTSEDGGFSIPSNPETPTSEQLTATRPIGRDKAKRKGKCKVSQSESTHESAVAAELRTMRLTRDAEAELIMTRIELEREKLQRNAMKMKEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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