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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002312`

染色体: Chr02 坐标: 40741387-40741713 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002312`
名称	SmilChr02G002312
描述	40S ribosomal protein S5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40741387 - 40741713 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008457`
GeneID	`131008457`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008457`
原始查询	`LOC131008457`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S5-like
产物	40S ribosomal protein S5-like
Arabidopsis	`AT2G37270` (RPS5B) ribosomal protein 5B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818304] identity=71.3; qcov=1.17; evalue=8.12e-49; confidence=medium
Rice	`Os11g0482000` (RPS5A) - identity=74.1; qcov=1.17; evalue=1.69e-49; confidence=medium
GO	GO:0000028 (ribosomal small subunit assembly); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	-
Pfam	PF00177 (Ribosomal_S7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008457

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057791316.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057791316.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057791316.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057791316.1`
5	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057791316.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40741444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B139,C17
`Chr2:40741476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr2:40741477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,C16,C60,C61
`Chr2:40741547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B104,C30
`Chr2:40741560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B104,C30
`Chr2:40741573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr2:40741594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:40741656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B41,C3
`Chr2:40741658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B104,C30,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791316.1

92 aa

Ribosomal_S7

PF00177 Ribosomal_S7 37-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791316.1`	Pfam	`PF00177`	Ribosomal_S7	Domain	37	92	5.2e-16	59.3	Ribosomal protein S7p/S5e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935333.1
ATGGAGATCATCTATTTGTTGACTGACCTGAACCCAATTCAAGTAATTGTTGATGCAGTTATCAACAATGGGTTAAGCGAAGATGCCACCCGTATTGGGTCAACTGGAGTGGCTATTTACCTGCTCACCACTGGTGCTCGTGAAAGTTCCTTCAGAAACGTCAAGACTATTGCAAAGTGCCTTGCTGATGAACTTATTAATGCCGCAAAAGGCTCTTCAAACAGCTACGTTATAAAGAAGAAGGATGAGATTGAGAGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008457
ATGGAGATCATCTATTTGTTGACTGACCTGAACCCAATTCAAGTAATTGTTGATGCAGTTATCAACAATGGGTTAAGCGAAGATGCCACCCGTATTGGGTCAACTGGAGTGGCTATTTACCTGCTCACCACTGGTGCTCGTGAAAGTTCCTTCAGAAACGTCAAGACTATTGCAAAGTGCCTTGCTGATGAACTTATTAATGCCGCAAAAGGCTCTTCAAACAGCTACGTTATAAAGAAGAAGGATGAGATTGAGAGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791316.1
MEIIYLLTDLNPIQVIVDAVINNGLSEDATRIGSTGVAIYLLTTGARESSFRNVKTIAKCLADELINAAKGSSNSYVIKKKDEIERVAKANR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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