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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002328`

染色体: Chr02 坐标: 40967261-40967923 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002328`
名称	SmilChr02G002328
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00310-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40967261 - 40967923 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008463`
GeneID	`131008463`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008463`
原始查询	`LOC131008463`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=45.3; qcov=0.623; evalue=1.24e-40; confidence=medium
Rice	`Os01g0714225` - identity=41.6; qcov=0.568; evalue=5.73e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008463

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791322.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791322.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057791322.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791322.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791322.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40967334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:40967366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:40967392`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A1,A10,A8,B111,B117,B127,B139,B3,B41,B57,B58,B66,B71,B74,B88,C14,C20,C42,C59,C67,C75
`Chr2:40967445`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B114,C23,C29,C38,C55,C56
`Chr2:40967449`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B114,C23,C29,C38,C55,C56
`Chr2:40967460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr2:40967469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B68,B95,C14
`Chr2:40967471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr2:40967473`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B123,B51
`Chr2:40967473`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B123,B51
`Chr2:40967475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr2:40967477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935339.1
ATGGACAAATCGTCCATCACTTACAGTCCGAACACAACAAAAGAGAGTGAAGTGGAGATTGGAAGGGTGCTAGGAGTGAAGGCGAGAGATGGGATTCAAAGATACCTGGGCTTGCCAGCTTTCTCTCTAAGGAAAAAAAGGCTTCAATTTAGGTATTTGAGAGATAGAATGGAGAAGAAAGTACAGACGTGGAGCCAACGAGATTTCTCTGCAGGGGGAAAAGAAGTTCTCATTAAGTCGGTGGTGCAAGCAGTGCCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008463
ATGGACAAATCGTCCATCACTTACAGTCCGAACACAACAAAAGAGAGTGAAGTGGAGATTGGAAGGGTGCTAGGAGTGAAGGCGAGAGATGGGATTCAAAGATACCTGGGCTTGCCAGCTTTCTCTCTAAGGAAAAAAAGGCTTCAATTTAGGTATTTGAGAGATAGAATGGAGAAGAAAGTACAGACGTGGAGCCAACGAGATTTCTCTGCAGGGGGAAAAGAAGTTCTCATTAAGTCGGTGGTGCAAGCAGTGCCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791322.1
MDKSSITYSPNTTKESEVEIGRVLGVKARDGIQRYLGLPAFSLRKKRLQFRYLRDRMEKKVQTWSQRDFSAGGKEVLIKSVVQAVPIYAMQCFRLPDSICDDMHRICAAFWWGDKENERHLHWKRWDKLCIPKDKGGMGFRDFKVFNKALVAKQVWRMLTRPDSLVTRVFRAKYFKDGDLLNTPVPARASYVWRSMAWSREIIKDGMGWKMGNGHNICIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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