当前解析结果
SmilChr02G002338| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002338 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002338 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002338 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 41071825 - 41072379 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008466 |
|---|---|
| GeneID | 131008466 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008466 |
| 原始查询 | LOC131008466 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=low |
| 产物 | OS-CAD; symbol=OS-CAD; hit=Os03g0581100; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT4G19990 (FRS1)FAR1-related sequence 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827744] identity=44.2; qcov=0.234; evalue=3.24e-07; confidence=weak |
| Rice | Os03g0581100 (OS-CAD)- identity=29.4; qcov=1.02; evalue=1.9e-19; confidence=low |
| GO | GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008466 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791325.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791325.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791325.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791325.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057791325.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:41072089 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B7,C4,C40 |
Chr2:41072316 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,C32 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。