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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002361`

染色体: Chr02 坐标: 41386572-41388753 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002361`
名称	SmilChr02G002361
描述	uncharacterized SmilChr02G002361
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41386572 - 41388753 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008473`
GeneID	`131008473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008473`
原始查询	`LOC131008473`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=28.6; qcov=0.425; evalue=1.34e-19; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791331.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791331.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791331.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791331.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791331.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41386583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	117	A10,A11,A13,A14,A19,A21,A25,A4,A7,A9,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B113,B12,B122,B124,B126,B127,B130,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B2,B20,B21,B28,B29,B3,B31,B37,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B53,B54,B55,B56,B60,B64,B66,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B79,B81,B82,B84,B87,B89,B90,B92,B93,B95,B96,B98,B99,C10,C12,C13,C14,C18,C19,C21,C22,C23,C26,C32,C34,C37,C41,C43,C48,C49,C50,C52,C53,C54,C56,C57,C61,C62,C65,C68,C72,C73,C74,C76,C78,C8,C81,C82,C86,C87,D1,D10,D11,D4,D5,D8,D9
`Chr2:41386640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B81
`Chr2:41386658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,B91,C17,D2,D3
`Chr2:41386659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	53	A15,A16,A20,A8,B11,B110,B121,B129,B133,B135,B137,B18,B19,B22,B23,B30,B33,B35,B52,B57,B6,B60,B65,B7,B74,B75,B79,B8,B86,B88,B9,B98,B99,C10,C23,C28,C30,C32,C35,C36,C37,C4,C40,C41,C46,C51,C67,C68,C7,C71,C75,C77,C85
`Chr2:41386669`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B132,B69,C3
`Chr2:41386669`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B132,B69,C3
`Chr2:41386671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:41386703`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B3,B31,B58,C24,C64,C66
`Chr2:41386705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B81
`Chr2:41386725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	113	A10,A11,A13,A14,A19,A21,A25,A4,A9,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B113,B12,B122,B124,B126,B127,B130,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B2,B20,B21,B28,B29,B3,B31,B37,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B53,B54,B55,B60,B64,B66,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B81,B82,B84,B87,B89,B90,B92,B93,B95,B96,B99,C10,C12,C13,C14,C18,C19,C21,C22,C23,C26,C32,C34,C37,C41,C43,C48,C49,C50,C52,C53,C54,C56,C57,C61,C62,C65,C68,C72,C73,C74,C76,C78,C8,C82,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D4,D5,D8,D9
`Chr2:41386730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B69,C3
`Chr2:41386733`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A2,A22,B103,B115,B12,B121,B124,B127,B131,B132,B136,B16,B17,B22,B23,B36,B48,B51,B59,B64,B67,B72,B73,B88,B90,B92,B94,C1,C16,C19,C25,C30,C33,C45,C53,C56,C64,C66,C80,C81,D2,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791331.1

510 aa

255

510

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 23-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791331.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	23	110	8e-09	36.2	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935348.1
ATGGCAGTGTGGTTCGATGTAGAGAAGTTCTCTGGGAAGAACGATTTCGGCCTTTGGCGTATAAAAATGAAGGCGATGCTAATCCAGCAAGGTTTAGCAGGCGCACTTAATGCAGATTCGGAGAAGAAGGATCCTGACGCAAAGATCGATCAACAGATGAGGAAAATGATGGAGAAGGCTCATAGCACAATTATACTTTATTTGACTGACAAAGTCTTTAGAGAAGTCTCAAGGGAATCTAATGTTGTTGGTGTATGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008473
ATGGCAGTGTGGTTCGATGTAGAGAAGTTCTCTGGGAAGAACGATTTCGGCCTTTGGCGTATAAAAATGAAGGCGATGCTAATCCAGCAAGGTTTAGCAGGCGCACTTAATGCAGATTCGGAGAAGAAGGATCCTGACGCAAAGATCGATCAACAGATGAGGAAAATGATGGAGAAGGCTCATAGCACAATTATACTTTATTTGACTGACAAAGTCTTTAGAGAAGTCTCAAGGGAATCTAATGTTGTTGGTGTATGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791331.1
MAVWFDVEKFSGKNDFGLWRIKMKAMLIQQGLAGALNADSEKKDPDAKIDQQMRKMMEKAHSTIILYLTDKVFREVSRESNVVGVWAKLESFKNGKPPRGKMKAMEEKFHVCRRTVSHIWAEAKQQQSQGHAINSSSKKIARPRRKRVEIDLELIASLDLTKRSTIRRIASGINCNKSTVGRWIDQGLIKAHTSALKPDLTTQNKLLRLRFCLDAIEIGRLSHNLRFKSMQNIRLNHIELARTRTSYKKVMFICTVCRPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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