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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002363`

染色体: Chr02 坐标: 41410794-41412558 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002363`
名称	SmilChr02G002363
描述	WUSCHEL-related homeobox 9-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41410794 - 41412558 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008474`
GeneID	`131008474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008474`
原始查询	`LOC131008474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WUSCHEL-related homeobox 9-like
产物	WUSCHEL-related homeobox 9-like
Arabidopsis	`AT2G33880` (HB-3) homeobox-3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817958] identity=68.3; qcov=0.366; evalue=1.35e-48; confidence=low
Rice	`Os01g0667400` (DWT1) - identity=50; qcov=0.488; evalue=2.95e-42; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0050793 (regulation of developmental process)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791332.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791332.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791332.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791332.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791332.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41410920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C72
`Chr2:41410934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:41411030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:41411722`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B113,D9
`Chr2:41411722`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B113,D9
`Chr2:41411745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,C16,C60,C61
`Chr2:41412023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:41412124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr2:41412250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B64
`Chr2:41412315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791332.1

328 aa

164

328

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 47-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791332.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	47	106	9.8e-12	45.2	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935349.1
ATGTCTTCTTCAAACAGACACTGGCCTAGCTTGTTCAAATCCAAGTCCACTTCCAACACTAGCCCTACTCCATGGCACCATGATCATTTACCCAGAGATCTATACACACAAGCAGATGAGGAGAGAAGCCCGGAGCCGAAGCCGCGGTGGAACCCTCGGCCGGAGCAAATCCGAATTCTGGAAGGCATCTTCAACTCGGGGACGGTGAACCCTCCCCGAGATGAGATCAGAAGAATTAGGGCTCAGCTCCAAGAATTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008474
ATGTCTTCTTCAAACAGACACTGGCCTAGCTTGTTCAAATCCAAGTCCACTTCCAACACTAGCCCTACTCCATGGCACCATGATCATTTACCCAGAGATCTATACACACAAGCAGATGAGGAGAGAAGCCCGGAGCCGAAGCCGCGGTGGAACCCTCGGCCGGAGCAAATCCGAATTCTGGAAGGCATCTTCAACTCGGGGACGGTGAACCCTCCCCGAGATGAGATCAGAAGAATTAGGGCTCAGCTCCAAGAATTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791332.1
MSSSNRHWPSLFKSKSTSNTSPTPWHHDHLPRDLYTQADEERSPEPKPRWNPRPEQIRILEGIFNSGTVNPPRDEIRRIRAQLQEFGHVGDANVFYWFQNRKSRSKHKLRNIQTTKPRTPVTAAQASSSSSSDKSSPSRCNSNEKPPSLTSSTLIDLLNSPTTSVNQPFLAEPLLFSGQESCAALTHGICFPDLSQTCSDVSLGDLVPTNHGRSSKGEDDDQKAKLPQHQIGYAAPDLASLSPTNQIPQGPGLVEPTPPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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