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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002381`

染色体: Chr02 坐标: 41718345-41719333 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002381`
名称	SmilChr02G002381
描述	protein DOG1-like 4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41718345 - 41719333 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008479`
GeneID	`131008479`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008479`
原始查询	`LOC131008479`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DOG1-like 4
产物	protein DOG1-like 4
Arabidopsis	`AT4G18650` (AT4G18650) transcription factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827599] identity=49.5; qcov=0.957; evalue=1.74e-64; confidence=high
Rice	`Os01g0306400` (OsDOG1L-1) - identity=29.6; qcov=0.961; evalue=4.1e-20; confidence=low
GO	GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF14144 (DOG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008479

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791335.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791335.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057791335.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791335.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791335.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41718748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:41718851`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B89
`Chr2:41718851`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B89
`Chr2:41718885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr2:41718909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B31,B58,C24,C64
`Chr2:41719025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B134,C33
`Chr2:41719082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:41719117`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B71
`Chr2:41719117`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B71
`Chr2:41719147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C24,C66
`Chr2:41719184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B91
`Chr2:41719192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791335.1

232 aa

116

232

DOG1

PF14144 DOG1 53-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791335.1`	Pfam	`PF14144`	DOG1	Family	53	110	7.5e-19	68.4	Seed dormancy control

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935352.1
TTTGTGGCATTCAATTTCCAAATCCAATCCTAAAGCTCTTAAGTTAAGTCTCCAATTAAAAGAATTATACTCCAAATCCAATCCTATAAGTCTTGAAGGGGTGAATCGCAATGTATCATATCTTTGTTTTTGAAAAAGAAAATAAAGAAATAGCGTTGGCGCTCATTTTCCATGAAGGTACACGCATTGATGCGGTGGCGACACGTTTGAGCTTGATTTCACCAGGTGGTACTCCCCATGCATGCACATCGAGTTTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008479
ATGATCGATCGAATTCATCCAATATATCAAATGAAAACCCTAGTGGAACACAAATTCTCGGATTTCTACAAGAAATGGATGGCCCAGCTGGAAGATCTCCTCGAGCTCCTCCTCGTGGCGGTGAAGGAGCCGCCGCAGGAACCCGGCTGCGCTGTGGCGGCGATCAGCAAGGTCACCGCCCACCACAAAGAATACTACAAGTTCAAATGGGCCGCGGCCCACGACGACGTGCTGGCCTTCTTCAGCGGCCCGGTTTGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791335.1
MIDRIHPIYQMKTLVEHKFSDFYKKWMAQLEDLLELLLVAVKEPPQEPGCAVAAISKVTAHHKEYYKFKWAAAHDDVLAFFSGPVWLSPLETAHLWITGWKPSAAFRLLRAACGGAVTEEQVRKIELLRVRMKAEEERVEREMERLQVAVADRNAVEMVRGKAAAAAAVGGFLGGLERVMKMADCVRLRTLKGLLEILSPMQSVHFLATNSLFQIRVRKFGMNIIETTNLAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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